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病毒整合型DNA的富集方法、测序数据分析方法和装置

摘要

本申请公开了一种病毒整合型DNA的富集方法、测序数据分析方法和装置。本申请的富集方法包括引物杂交和延伸步骤、磁珠分离和洗涤步骤;本申请的测序数据分析方法包括数据过滤步骤、拼接组装步骤、比对和断点判断步骤和基因注释步骤。本申请富集方法,采用特异性引物对病毒基因组靶标基因进行延伸,替换长探针,成本低,效率高、特异性强,缩短了富集时间。本申请的测序数据分析方法,与全基因组对比,节省数据量,能获得更高测序深度;获得更多病毒DNA断点信息,及在宿主基因组上的整合位置信息;不仅能获得由多reads支持的克隆性整合事件,而且能同时检测到单reads支持的非克隆性整合,构建病毒在宿主基因组上整合的全面图景。

著录项

  • 公开/公告号CN110273028A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2019-09-24

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 深圳市海普洛斯生物科技有限公司;

    申请/专利号CN201910570045.5

  • 发明设计人 陈实富;林海久;刘明;

    申请日2019-06-27

  • 分类号

  • 代理机构深圳鼎合诚知识产权代理有限公司;

  • 代理人李小焦

  • 地址 518000 广东省深圳市前海深港合作区前湾一路1号A栋201室

  • 入库时间 2024-02-19 13:03:53

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-10-22

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/70 申请日:20190627

    实质审查的生效

  • 2019-09-24

    公开

    公开

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