基于互模式熵的DNA序列相似性分析

摘要

cqvip:随着基因组计划的开展,DNA序列相似性分析成了现代生物学研究不可缺的一部分。本研究以H5N1、H1N1和H2N2等7种病毒的DNA序列作为研究对象,使用整数法将DNA序列编码成时间序列信息,计算时间序列之间的互模式熵(Mutual Mode Entropy,MME)。分析不同DNA序列的MME对序列相似性的表达准确性。实验表明通过整数表示方法的DNA序列的M M E能够定性地解释7种DNA序列之间的相似性关系。