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基于LF熵的DNA序列相似性检验方法

摘要

本发明公开基于LF熵的DNA序列相似性检验方法,通过对原始的DNA序列按着L‑Gram模型进行映射,得到一个新的数值序列。通过计算N条序列的LF熵值构成的矩阵,进而得出其标准熵,并投影到hamming空间进行序列相似性比对。本发明综合考虑到在转换后的特征空间包含足够的原始DNA信息,避免DNA信息的丢失;将每一段DNA序列转为一个新的空间,可以提高运算速度和精确度。

著录项

  • 公开/公告号CN106557668B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2019-04-05

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 福建师范大学;

    申请/专利号CN201610970981.1

  • 发明设计人 林劼;魏静;徐彭娜;江育娥;

    申请日2016-11-04

  • 分类号G16B30/00(20190101);G16B40/00(20190101);

  • 代理机构35211 福州君诚知识产权代理有限公司;

  • 代理人张耕祥

  • 地址 350108 福建省福州市闽侯县上街镇大学城福建师范大学科技处

  • 入库时间 2022-08-23 10:29:53

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-04-05

    授权

    授权

  • 2017-05-03

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/22 申请日:20161104

    实质审查的生效

  • 2017-05-03

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F 19/22 申请日:20161104

    实质审查的生效

  • 2017-04-05

    公开

    公开

  • 2017-04-05

    公开

    公开

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