基于样本熵的DNA序列相似性分析

摘要

针对传统方法在分析DNA序列相似性方面的不足,提出了一种基于样本熵的DNA序列相似性分析方法。以5种东亚钳蝎神经毒素的基因序列作为分析对象,首先通过DNA序列的图形表示把DNA序列转换为时间序列,然后运用样本熵算法计算出时间序列的样本熵值,将样本熵的互值大小作为分析序列之间相似性的依据,最后将样本熵方法与DTW（Dynamic Time Warping,动态时间弯曲）方法的实验结果进行比较。实验结果表明,样本熵分析方法能有效分析序列之间的相似性,与DTW分析方法相比较,显示出更强的相似性和区别度,可将其进一步应用于生物序列的分析。