基因共表达网络的构建及分析方法研究综述

摘要

随着高通量生物实验技术的快速发展,特别是基因芯片和新一代测序技术的发展,全基因组范围内的基因表达数据呈爆炸式增长.利用网络生物学的方法对高通量基因表达数据进行分析和挖掘已经成为生物信息学重要的研究方向.对基因共表达网络的研究与分析从系统层面上加深了研究人员对生物系统的认识.本文综述了基因共表达网络的构建和分析的常用方法,主要包括基因相似性度量方法、阈值选择方法、拓扑分析方法、基因模块识别及其功能注释方法,并对一些常用的分析工具进行了分析总结.