猪瘟病毒四川分离株E2基因克隆及生物信息学分析

摘要

利用GenBank登录的猪瘟病毒(CSFV)参考株(登录号:NC_009089.1)的E2基因序列设计特异性引物,PK-15细胞培养增殖CSFV四川分离株提取RNA,采用RT-PCR技术扩增CSFV疫苗株E2基因,将PCR扩增产物克隆入Pet-32a-BL21载体构建重组质粒门Pet-32a-E2,并进行测序鉴定.测序结果显示,构建的Pet-32a-E2质粒含有1个开放阅读框(ORF),全长1119 bp,共编码373个氨基酸,与GenBank登录的CSFV参考株NC_009089.1的E2蛋白的核苷酸同源性为98.8％,氨基酸同源性为98.9％;与石门株兔化弱毒E2蛋白株的核苷酸同源性为94.4％,氨基酸同源性为93.9％.对E2基因及其编码蛋白进行生物信息学分析,结果显示,E2蛋白分子质量为41.6ku,等电点PI为5.72,是弱酸性蛋白;E2蛋白不含信号肽序列,为可溶性蛋白,有跨膜区,主要定位于细胞质内.通过生物信息学分析预测,为后期CSFV E2蛋白表达,开展蛋白功能研究奠定了基础.