RNA测序研究筛选血管紧张素Ⅱ诱导的心脏重构候选基因

摘要

目的 研究血管紧张素Ⅱ(AngⅡ)诱导的心脏重构的机制和筛选潜在治疗靶点.方法 大鼠心脏成纤维细胞(CFSs)加入10 nM AngⅡ后培养12h,对照组未加入AngⅡ.从2组样品中提取RNA后,检测细胞基因表达水平.使用R语言中的limma软件包筛选两组样本间的差异表达基因(DEGs),并通过富集分析探讨它们的功能和参与的信号通路.此外,通过蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建揭示它们在蛋白水平的关系.结果 共筛选了126个上调基因和140个下调差异表达基因.根据富集分析发现:其中的ACACB,IL1B,IL1A,NOS2和MMP3与免疫反应、血管生成的调控、超氧代谢过程和羧酸结合生物过程高度相关.PPI网络构建显示:ACACB和MPP3是两个主要节点.结论 ACACB,IL1B,IL1A,NOS2和MMP3这五种基因,可能是AngⅡ诱导心脏重构的重要候选标志物.