一种高效研究RNA相互作用组的高通量测序方法及其应用

摘要

本发明公开了一种高效研究RNA相互作用组的高通量测序方法及其应用。该方法包括如下步骤：(1)根据待测RNA的长度，每隔100bp设置一条DNA探针；(2)将细胞用1～3％(v/v)的甲醛溶液交联固定细胞后进行超声破碎，得到核酸的长度范围为100～500nt细胞裂解液；(3)加入DNA探针进行杂交，再对目标RNA进行富集，洗涤，纯化，得到RNA碎片；(4)将RNA碎片的3’末端和RNA接头连接，然后将产物逆转录成cDNA，再将cDNA的3’末端与DNA接头连接，得到目标RNA与其相互作用RNA的文库；(5)对文库进行扩增，再进行检测分析。该方法能够用于对低含量的相互作用RNA进行文库构建。