基于下一代测序技术筛选先天性心脏病胎儿心脏组织中差异表达的miRNA

摘要

目的：基于下一代测序技术筛选先天性心脏病胎儿心脏组织中差异表达的miRNA,为先天性心脏病在胎儿期的诊断和治疗中的miRNA干预策略提供可供选择的目标靶点。方法：选取3例因患先天性心脏病而引产的胎儿,3例孕龄相似,无心脏畸形的3例胎儿为对照组,从胎儿心脏组织中提取小RNA,利用基于SOLiD原理的miRNA下一代测序技术,结合生物信息学的方法对先天性心脏病胎儿心脏组织中已知miRNA的类型、丰度及靶基因进行分析。结果：靶基因预测结果表明，这些48种miRNA基因涉及了转录调控、物质能量代谢、细胞增殖和凋亡等过程。得到的靶基因进行Pathway显著性分析，发现WNT信号通路与靶基因功能显著相关。结论：miRNA参与心脏发育过程，在先天性心脏病的发病机制中可能发挥重要作用，有望成为先天性心脏病在胎儿期的诊断和治疗的新靶点。