1株越南斗鸡新城疫病毒的分离和分子鉴定

摘要

从一起新城疫暴发的病例中分离出1株新城疫病毒（NDV），命名为贵州分离株（DQ）。用RT—PCR方法扩增了贵州分离株的整个F基因片段，并将其克隆到pMD18-T载体中。序列分析结果表明，上述分离株F基因长度为1662bp，编码553个氨基酸。该毒株与国内2株分离株（CH2000、TW2000）之间的亲缘关系较近，其核苷酸和氨基酸序列同源性分别为95．7％～96．6％和96．6%～96．8％；但与LaSota、B1及F48E9等常见毒株的核苷酸和氨基酸同源性仅为84．0％～86．5％和87．2％～89．9％。DQ分离株在F蛋白裂解位点的氨基酸顺序为^112R—R—Q_K—R—F^117，与NDV强毒株特征相符，且具有101处的K（赖氨酸）和121处V（缬氨酸）2个特征性氨基酸，与NDV基因Ⅶ型的特性完全相符。利用MegAlign软件绘制NDV的系统发育进化树，结果表明，该分离株为基因Ⅶd亚型。