急性呼吸道感染患儿肠道病毒流行病学分析和基于VP1基因分型的巢式RT-PCR方法学评价

摘要

目的分析急性呼吸道感染患儿肠道病毒流行病学特点,建立一种快速、灵敏及特异的肠道病毒VP1基因分型巢式RT-PCR检测方法。方法选取2015年1月-2018年12月该院肠道病毒通用引物阳性的640例急性呼吸道感染患儿,应用巢式RT-PCR进行肠道病毒分型,PCR阳性产物测序分析鉴定,明确肠道病毒流行病学特征和主要基因型。结果 640例阳性样本中,313例测序成功,其中EV71型男性检出率为5.75%(18/313),女性检出率为3.51%(11/313);CA16型男性检出率为8.63%(27/313),女性检出率为7.67%(24/313);CA6型男性检出率为17.89%(56/313),女性检出率为10.86%(34/313);CA10型男性检出率为9.58%(30/313),女性检出率为11.50%(36/313);CA2型男性检出率为1.92%(6/313),女性检出率为1.92%(6/313);CA4型男性检出率为3.19%(10/313),女性检出率为2.88%(9/313);其他型男性检出率为8.31%(26/313),女性检出率为6.39%(20/313)。不同性别患儿肠道病毒CA6型检出率比较差异有统计学意义(χ^(2)=10.756,P<0.05)。按照年龄分组,萧山地区的儿童呼吸道感染病例以1~岁最常见,占阳性例数的30.67%。测序分型的型别包括EV71型29例(9.26%),CA16型51例(16.29%),CA6型90例(28.75%),CA10型66例(21.08%),CA2型12例(3.83%),CA4型19例(6.07%),CB1型14例(4.47%),CB3型9例(2.87%),CB5型12例(3.83%),Echo11型5例(1.59%),Echo30型6例(1.92%)。结论肠道病毒感染患儿主要临床表现以急性上呼吸道感染为主,其优势基因型为CA6型和CA10型,基于VP1基因分型的巢式RT-PCR具有较好的特异性。