新型CDK9小分子抑制剂的设计和发现

摘要

目的 通过同源模建、计算机虚拟筛选和生物活性筛选,寻找新型的CDK9小分子抑制剂.方法 采用同源模建方法得到CDK9的三维晶体构象,用DOCK(分子对接)对小分子三维数据库进行虚拟筛选.采用MTT法对挑选出的化合物进行生物活性测定,然后挑选高活性的化合物进行CDK9与小分子之间相互作用的研究,验证化合物对CDK9激酶活性的抑制作用.结果 用DOCK程序对三维化合物库虚拟筛选后挑选出得分高的前1 000个化合物,按结构差异化分类,最终选择并购买了27个代表性化合物进行进一步生物学活性测定.27个化合物中12个化合物明显抑制肿瘤细胞的增殖,其中1个化合物C-21的半数抑制浓度(IC50)在20 μmol·L-1以下.选择C-21类化合物进一步进行研究,结果显示此化合物能够有效抑制各类肿瘤细胞系的增殖.酶学水平研究表明此类化合物能够有效抑制CDK9激酶活性,并在较低浓度范围内呈明显的剂量依赖关系.结论 通过同源模建、计算机虚拟筛选、生物活性实验和分子水平研究,得到了一类靶向CDK9的全新的先导化合物.