手足口病患儿176例病原检测及肠道病毒71型基因特征分析

摘要

目的 研究手足口病(HFMD)病原构成,对引起HFMD的肠道病毒71型(EV71)进行基因特征分析.方法 采集2013年6月至8月天津市儿童医院176例临床诊断HFMD患儿的咽拭子标本,应用实时逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测标本中的肠道病毒.选取EV71阳性标本扩增基因的VP1区,测序并比对,构建进化树分析.结果 176例标本中肠道病毒总阳性率为68.8％,其中EV71为32.4％,柯萨奇病毒A组16型(CVA16)为4.0％,EV71和 CVA16双阳性为1.7％,其他肠道病毒(EV)28.4％.EV71 VP1区与C4a基因型代表株核苷酸同源性为96.6％ ～ 98.9％,氨基酸同源性为98.8％～ 100％,亲缘进化分析显示本地区EV71与C4a基因型代表株处于同一分支.结论 EV71是2013年天津市儿童医院手足口病住院患儿主要病原,且属于C4a基因亚型.