猪圆环病毒2型感染人源细胞的转录组分析

摘要

目的 圆环病毒2型(porcine circovirus type 2,PCV2)能否感染人类细胞一直都是一个争论的话题.本研究通过转录组测序(RNA sequencing,RNA-seq)技术分析PCV2感染人源细胞后的差异表达基因及其相关的信号通路、生物学功能,以期为人源细胞对PCV2及其他病毒产生抗病毒效应的研究提供参考.方法 用PCV2感染HeLa细胞,然后进行RNA-seq技术分析,筛选与抗病毒反应相关的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并通过实时定量PCR进一步验证.结果 在感染PCV2的HeLa细胞中共注释到15402个UniGenes,其中有387个DEGs(包括267个上调基因和120个下调基因).对生物过程类DEGs进行GO富集和KEGG通路分析,发现富集基因要参与应激反应(97/291 DEGs)和免疫系统过程(80/291 DEGs),其中最显著两条途径的基因是NOD样受体信号途径(21/170 DEGs)和单纯疱疹病毒感染途径(22/170 DEGs)相关差异表达基因.结论 PCV2感染HeLa细胞之后,改变了细胞的表达谱,获得的DEGs及其功能注释信息有助于理解其抗病毒机制,对于了解PCV2感染人源细胞所产生的免疫反应及抗病毒效力提供依据.