基于DNA甲基化模式筛选评估结肠腺癌预后的标记物

摘要

为了通过分析DNA甲基化谱识别出与预后相关的结肠腺癌亚型.从TCGA数据库获取了结肠腺癌患者的甲基化数据,通过差异甲基化分析和构建COX比例风险回归模型筛得与预后显著相关的CpG位点,并通过一致性聚类识别出7个亚型.生存分析和临床特征检验显示7个亚型间预后差异显著且亚型特征可由多种临床特征反映.此外,用7个亚型间识别出的差异甲基化位点构建的基于SMO(序列最小最优化)的预测模型在各亚型上都有较高的AUC值,并用检验集进行了验证.综上,本研究利用生物信息学算法识别了7个预后差异的结肠腺癌亚型并挖掘了它们的特异性甲基化标记.该研究结果或可使得结肠腺癌预后被更精准地评估,为早期诊断及治疗方案提供新思路.