基于TCGA数据库的胃癌预后miRNAs筛选及预后评估模型构建

摘要

目的:利用TCGA数据库中胃癌miRNA测序数据筛选预后相关miRNA并构建预后评估模型。方法:利用R中RTCGA包下载胃癌miRNA表达谱数据和临床信息,基于R中Survival包依次进行单变量Cox回归分析筛选胃腺癌预后相关miRNA,进一步利用多变量Cox回归分析(比例风险模型)构建预后评估模型。利用在线数据库对预后相关miRNA进行靶基因预测和信号通路富集分析。结果:利用单变量Cox回归分析筛选到34个胃癌预后相关miRNA(P<0.05),进一步通过多变量Cox回归分析构建基于14-miRNA的胃腺癌预后评分模型,生存分析显示基于该评分模型的低风险组预后显著优于高风险组,差异有统计学意义(P<0.01),ROC曲线显示该模型具有良好的预测效果(AUC=0.793)。对14-miRNA的靶基因信号通路富集分析显示与癌症相关信号高度相关。结论:14-miRNA风险评分模型具有良好的预后预测效果。