黑曲霉NRRL3135 bgl基因的克隆及序列分析

摘要

利用RT-PCR技术从黑曲霉菌株NRRL3135中扩增了β-葡萄糖苷酶(BGL)基因的全长cDNA序列,被命名为bgl3135(GenBank登录号:FN430671).对该基因编码的BGL进行了同源性分析并预测了其三维构象.试验结果表明,bgl3135的全长cDNA为2 598 bp,含有一个2 583 bp的开放阅读框(ORF),编码一个长度为860个氨基酸残基的蛋白质.同源性分析表明,该基因编码的蛋白与来自黑曲霉As3.350和CBS513.88的BGL(GenBank登录号分别为DQ655704和XM_001398779)的相似性最高,其氨基酸序列同源性分别达99%.参照已发表的β-葡萄糖苷酶(BGL)的氨基酸保守序列,判断本研究所克隆的bgl基因属于糖苷水解酶基因家族3的成员.三维结构预测表明,该BGL的立体构象中存在20个α-螺旋和15个β-折叠,对构成和维持酶的底物识别和催化活性位点可能起着重要作用.