东北虎粪细菌区系的16S rRNA基因序列分析

摘要

为研究东北虎粪微生物区系建立了东北虎粪细菌的16S rDNA文库.通过EcoRⅠ和HindⅢ分别对阳性克隆进行酶切分析,从东北虎的16S rDNA文库中分别获得了15个具有酶切差异的克隆.BLAST分析结果显示,在15个克隆中,10个克隆与梭菌属成员有97%以上的同源性,其中有6个序列与诺维梭菌A型(Clostridium novyi type A)有99%的同源性,为诺维梭菌A型;4个序列与猪粪细菌RT-18B(Swine manure bacterium RT-18B)有97%的同源性,为消化链球菌属(Peptostreptococcus)成员.其它序列与GenBank中登录的序列同源性低于97%,为5种未培养细菌,其中4种16S rRNA基因序列分别与Clostridium pascui 、破伤风梭菌E88(Clostridium tetani E88)、梭菌(Clostridium sp.)14505及产气荚膜梭菌(Clostridiumperfringens)有94%～95%的相似性.第5种与肉杆菌(Carnobacterium sp.)R-7279株有94%的同源性.