蒙古狼线粒体基因组序列分析及其系统发育地位

摘要

应用Long-PCR和克隆测序法得到蒙古狼(Canis lupus chanco)线粒体基因组全序列,结合GenBank中现有犬科动物线粒体基因组数据,应用最大简约法(MP)、最大似然法(ML)和Bayesian分析法对蒙古狼的系统发育地位进行了探讨.结果如下:蒙古狼线粒体基因组全长16709 bp,包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个非编码区.序列碱基的组成存在明显的A-T偏好性.tRNA基因中除tRNA-Set(AGY)缺少双氢尿嘧啶(DHU)臂以外,其余均能折叠成典型的三叶草二级结构.大多数蛋白质编码基因的起始和终止密码子与犬科动物有报道相同,COX Ⅱ基因的起始密码子为ATA,与其他犬科动物不同.基于12S rRNA+16S rRNA+H链上的12个蛋白质编码基因的联合数据的系统发育分析发现,在已报道的狼亚种数据中,西藏狼(Canis lupus laniger)的分化时间最早,其次为阿拉伯狼(Canis lupus arabs),蒙古狼与欧亚狼(Canis lupus lupus)的系统发育地位最为接近.