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甘蓝型油菜BnFAD2-C1基因全长序列的克隆、表达及转录调控元件分析

         

摘要

脂肪酸去饱和酶基因(FAD2)是控制植物体中油酸含量的关键基因,在甘蓝型油菜中有4个FAD2基因的拷贝,分别定位在A1、C1、A5、C5染色体上。本文克隆了1个FAD2拷贝基因,依据油菜基因组数据库信息,将其定位到C1染色体上,命名为BnFAD2-C1,其开放阅读框为1155 bp。采用RACE (rapid-amplification of cDNA ends)技术获得了175 bp的5¢ UTR序列和212 bp的3¢ UTR序列。采用荧光定量PCR技术研究发现,BnFAD2-C1在根、花和角果皮中仅保持本底水平的表达,在种子发育中期呈现高效表达,具有种子特异性诱导表达的特征。根据甘蓝和油菜基因组数据库信息,同源克隆到BnFAD2-C1基因的启动子(promoter)和内含子(intron)序列,并通过PLACE和PlantCARE网站分析,初步预测到调控该基因转录的潜在顺式作用元件。通过茉莉酸诱导处理, BnFAD2-C1基因表达量发生变化,推断茉莉酸在BnFAD2-C1基因的表达过程中可能发挥一定的调控作用。%Fatty acid desaturase gene (FAD2) is a key factor in regulating oleic acid content. There are four copies ofFAD2 lo-cated on chromosomes A1, C1, A5, and C5 inBrassica napus. One copy containing 1155 bp openreading frame was cloned with previous research method and named asBnFAD2-C1, which was location on chromosome C1 based on the genome database in-formation of oleracea and oilseed. The untranslated regions (UTR) of 5′ and 3′ end with 175 bp and 212 bp length respectively were cloned by RACE (rapid-amplification of cDNA ends) technique. The expression pattern ofBnFAD2-C1 gene was identified using quantity PCR technique, showing a seed-specific inducible expression in mid developmental seeds and a background-level expression in root, flower and siliqua wall. The promoter and intron region were also cloned and analyzed using PLACE and PlantCARE websites to predict some potential cis-elements in regulatingBnFAD2-C1gene transcription. At the same time, jas-monic acid (JA) was inferred to make certain contributions to regulateBnFAD2-C1gene expression showing a changeable ex-pression quantity when treated with jasmonic acid.

著录项

  • 来源
    《作物学报》 |2015年第11期|1663-1670|共8页
  • 作者单位

    湖南农业大学农学院/国家油料改良中心湖南分中心;

    湖南长沙 410128;

    湖南农业大学农学院/国家油料改良中心湖南分中心;

    湖南长沙 410128;

    湖南农业大学农学院/国家油料改良中心湖南分中心;

    湖南长沙 410128;

    湖南农业大学农学院/国家油料改良中心湖南分中心;

    湖南长沙 410128;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类
  • 关键词

    甘蓝型油菜; BnFAD2-C1基因; RACE; 生物信息学分析; 茉莉酸;

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