IGF-1R基因SNPs检测及其与水貂生长性状的关联分析

摘要

为了研究胰岛素样生长因子1受体(IGF-1R)基因外显子2和外显子11的单核苷酸多态性,分析该基因变异与水貂生长性状的关联性,以红眼白水貂、金州黑水貂和咖啡水貂共计235个样本的血液基因组DNA为模板,采用PCR产物克隆和Sanger测序技术,筛查IGF-1R基因SNP位点,将差异位点与不同种群的水貂生长性状进行关联分析.结果表明,红眼白、金州黑水貂的外显子2和外显子11上检测到2个SNPs:c.207G>A和c.1782G>A;咖啡水貂在外显子2上检测到2个SNPs:c.207G>A和c.218T>A,在外显子11检测到1个SNPs:c.1782G>A.c.207G>A和c.1782G>A都属于无义突变.c.218T>A位点属于有义突变,氨基酸发生改变,脯氨酸变为精氨酸.关联分析表明:c.207G>A与金州黑水貂和咖啡水貂体长性状显著相关(PA与咖啡水貂的体长和体质量显著相关(PA位点GG基因型是水貂体长的优势基因型;合并基因型GGGA和GGAA可能是影响金州黑水貂体长体质量的有利基因型,认为IGF-1R基因可能是影响水貂生长性状的候选基因.