RAPD多态位点数变化对小豆遗传变异信息估计的影响

摘要

以163份来自于中国、日本、韩国、不丹、尼泊尔和越南6国的各种类型小豆种质资源的大样本群体为材料,利用27条RAPD引物检测该群体得到的261个等位基因数据构建成"总群体",采用完全随机抽样方法,研究不同样本容量(样本位点数)与系统遗传相似系数(Jaccard系数)变化的关系,并进一步配置出不同引物数量、多态位点与Jaccard系数的变异系数曲线方程,通过分析回归曲线的相应切点,确定在一定精度下适合的引物数量及多态位点数.研究结果表明:不同引物数量之间的Jaccard系数的标准差、平均数、变异系数差异极显著. 不同引物数量、不同多态位点与Jaccard系数的变异系数、标准差回归方程为Y=a+b/X形式,决定系数均在0.95以上. RAPD遗传信息分析精度控制在5%～10%时的最适样本容量为15～32条随机引物或120～230个多态性位点.