东乡野生稻MYB转录因子LOC_Os01g62410-DX苗期低温诱导荧光定量表达分析及克隆

摘要

为了阐明东乡野生稻中MYB转录因子基因LOC_Os01g62410-DX在低温胁迫条件下的功能作用机制,依据课题组前期的转录组分析数据,以东乡野生稻和籼稻品种“93-11”为材料,通过实时荧光定量PCR分析该基因位点在冷胁迫条件下的表达模式。并参考公共数据库中测序水稻品种日本晴对应位点的序列信息设计引物,利用RT-PCR技术,从东乡野生稻中扩增获得LOC_Os01g62410-DX基因的全长cDNA,构建该基因的过表达载体。序列分析结果表明,LOC_Os01g62410-DX基因的cDNA全长为1500 bp,共编码499个氨基酸,蛋白质分子质量为55.04 ku,理论等电点(pI)为7.62。在线分析软件预测LOC_Os01g62410-DX氨基酸序列N端包含2个高度保守结构域SANT,表明该基因属于R2R3类MYB转录因子。系统进化分析结果表明LOC_Os01g62410-DX与水稻Osmyb3和Osmyb4编码的蛋白位于邻近分支上,亲缘关系最近。进一步利用农杆菌介导转基因方法,获得转入LOC_Os01g62410-DX基因的37株阳性转基因植株,为深入研究东乡野生稻LOC_Os01g62410-DX基因在低温胁迫条件下的作用机制奠定材料基础。