ナノポアに詰まる ナノポアに詰まる DNA のメカニズム のメカニズム の

摘要

オーダーメイド医療において、DNAシークェンサ一は重要なツールとなる。半導体ナノポアを用いた次世代DNAシークェンシング法は、低コストかつ非常に高いスループット、長時間読み取 り、標識を必要としないことが期待されている。この方法は、電気泳動によりナノポアにDNAを 通過させる際のィォン電流値の変化[1]、あるいはポア内のnano-gap電極によるトンネル電流[2]か らDNAの塩基配列を読み取る方法である。しかし、10 kbp以上のDNAを用いると、ナノポアにDNAが詰まる[3,4]。そこで、我々は詰まりの要因がknot生成などで予想される①DNAの有限の persistence lengthによる幾何学的な相互作用なのカゝ、あるいは②DNA自身の電荷によるポア内電 気浸透流(Fig.1)か、を調べるために、様々なDNAの長さや形態（直鎖状と環状）の違いによるDNA のナノポアへの詰まりの確率と、ナノポア径との関係をDNAの直接観測により調べた。また、幾 何学的な相互作用の要因と思われるpersistence lengthを小さくするnic (切れ目）DNAも用いて、 ポア近傍におけるDNAの挙動を調べた。