近交系五指山猪群体中DRA和DRB等位基因的SSCP检测及新等位基因的发现

摘要

目的:确定在近交系五指山猪(WZSP)群体中,SLA-ⅡDRA、DRB基因的等位基因数及其特性.方法:PCR扩增SLA-ⅡDRA、DRB基因的第二外显子序列,经单链构象多态性即SSCP检测其等位基因数,选择纯合子个体的PCR产物直接测序.对所获得的序列与Genbank中所有相应的序列,特别是SLA-DRB-C、SLA-DRB-D、HLA-DRB*09012、HLA-DRB*1201、HLA-DRA*0101进行比对分析.结果:在近交系WZSP群体中,DRA,DRB各有两个等位基因且发现一个DRB新等位基因.DRA第二外显子有很强的保守性,核苷酸和氨基酸水平同源性均为99％;而DRB基因呈现出高度的多态性,在核苷酸水平同源性为85％以上,氨基酸水平同源性为70％以上.结论:成功地检测了近交系WZSPSLA-DRA、DRB基因的等位基因及其特性,为建立WZSPSLA-DR基因抗原的分子分型及基因功能的研究打下基础.