五指山猪近交系群体中DRA和DRB基因的SSCP检测

摘要

为确定五指山猪(WZSP)近交系群体SLA-ⅡDRA、DRB基因的等位基因数及其特性,利用PCR扩增SLA-ⅡDRA、DRB基因的第2外显子序列,经单链构象多态性即SSCP检测其等位基因数,选择纯合子个体的PCR产物直接测序.对所获得的序列与Genbank中所有相应的序列进行比对和聚类分析,特别是SLA-DRB-C、SLA-DRB-D、HLA-DRB*09012、HLA-DRB*1201、HLADRA*0101等位基因.结果表明:在WZSP近交系群体中,DRA、DRB各有2个等位基因且发现1个DRB新等位基因.DRA第2外显子有很强的保守性,而DRB基因呈现出高度的多态性,在核苷酸水平同源性为85%以上,氨基酸水平同源性为70%以上.该试验成功地检测了WZSP近交系SLA-DRA、DRB基因的等位基因及其特性,为建立WZSP SLA-DR基因抗原的分子分型及特异单倍型猪的培育研究奠定基础.