应用LongSAGE构建猪胚胎骨骼肌基因转录谱文库

摘要

构建LongSAGE文库研究猪发育早期的胚胎(妊娠33d)骨骼肌基因转录谱.测序50464个标签,得到单标签(Unitag)25750个.经生物信息学分析发现,与Unigene匹配的Unitag为6643个,不匹配的新标签(即无Unigene匹配的标签)为19107个.从表达丰度来看,单拷贝标签高达80.08﹪,而不匹配的标签绝大部分是低丰度表达标签,其中单拷贝的新标签占被检测到一次的Unitag数的83.41﹪.结果表明,猪早期胚胎骨骼肌中绝大多数基因呈低丰度表达,猪的大部分基因未被发现与鉴定,尤其是低丰度表达的基因.LogSAGE技术是研究基因表达转录谱的有效手段.