基于16S rDNA-ARDRA技术对冷藏鸡肉胴体中细菌群落的监控

摘要

本文运用ARDRA(amplified ribosomal DNA restriction analysis)技术研究了冷藏鸡肉胴体中的细菌多样性.采用改良CTAB法提取两批冷藏鸡肉胴体(冷藏60 d和90 d)的细菌宏基因组DNA来构建16S rDNA文库Ⅰ和Ⅱ,从中分别随机挑取57和71个阳性克隆子用Afa和Msp进行扩增rDNA限制性分析和UPGMA聚类分析.结果表明:从文库Ⅰ和Ⅱ中分别获得47和55个特异性条带、44和65个操作分类单元(OTUs),分别占总数的77.20%和91.50%,可见在构建的文库中细菌群落结构复杂,多样性高.文库Ⅰ和Ⅱ的细菌群落丰富度指数、香-威指数、辛普森指数、均匀度指数分别为13.36、3.64、0.97、0.91和16.19、4.15、0.98、0.98,表明文库Ⅱ的细菌多样性高于文库Ⅰ.