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Estimation of gene networks using biological constraints and estimation method

机译:利用生物学限制估计基因网络和估计方法

摘要

The accurate estimation of gene networks from gene expression measurements is a major challenge in the field of Bioinformatics. We present a general approach to reduce the search space to a biologically meaningful subspace and to find optimal solutions within the subspace in linear time by using inferential models constrained by biologically relevant information. We showed the effectiveness of this approach in application to yeast and Bacillus subtilis data. Also, we provide systems and storage media adapted to provide and store data and results of gene network relationships.
机译:从基因表达测量结果准确估计基因网络是生物信息学领域的主要挑战。我们提出一种通用方法,通过使用受生物学相关信息约束的推论模型,将搜索空间缩减为具有生物学意义的子空间,并在线性时间内在子空间内找到最佳解。我们证明了该方法在应用于酵母和枯草芽孢杆菌数据中的有效性。此外,我们提供适合提供和存储数据以及基因网络关系结果的系统和存储介质。

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