应用推导方法和生物学约束条件估计基因网络

摘要

从基因表达测定值中准确估计基因网络是生物信息学领域中是一个主要挑战。我们提供一般方法以将搜索范围减少至生物学有意义的子范围和通过使用以生物学相关信息约束的推导模型在线性时间内在子范围中寻找最优解决方案。我们列出该方案用于酵母和枯草芽孢杆菌数据的效果。并且，我们提供适合提供和存贮基因网络关系的数据和结果的系统和存贮介质。