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一种快速分析CRISPR/Cas9基因编辑载体构建情况的方法及应用

摘要

本发明公开了一种快速分析CRISPR/Cas9基因编辑载体构建情况的方法,包括如下步骤:S1、基于靶标区间设计载体通用引物,扩增,构建文库,送高通量测序,得到测序数据;S2、对步骤S1中得到的测序数据进行质控;S3、对步骤S2中得到的质控后的数据进行两端reads的拼接,获得长序列数据;S4、根据靶标区间前后的载体序列是已知、并且相同的特点,对步骤S3中获得的长序列数据进行分析,然后将靶标区间序列提取出来,进行统计分析,从而可以获得靶标的构建情况;该方法快速精准、成本低廉,可以多样品混合测序,鉴定成千上万个基因编辑载体,只需要1G的数据量即可以满足分析需求,因此,在植物、动物或微生物载体构建中的应用领域具有良好的应用前景。

著录项

  • 公开/公告号CN113528633B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2024.06.11

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 湖北伯远合成生物科技有限公司;

    申请/专利号CN202110924679.3

  • 发明设计人

    申请日2021.08.12

  • 分类号C12Q1/6869;

  • 代理机构武汉天领众智专利代理事务所(普通合伙);

  • 代理人王能德

  • 地址 438000 湖北省黄冈市黄州区新港北路19号黄冈光谷联合科技城C9幢1-2层101-104号

  • 入库时间 2024-07-23 17:22:15

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