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一种快速分析CRISPR/Cas9基因编辑载体构建情况的方法及应用

摘要

本发明公开了一种快速分析CRISPR/Cas9基因编辑载体构建情况的方法,包括如下步骤:S1、基于靶标区间设计载体通用引物,扩增,构建文库,送高通量测序,得到测序数据;S2、对步骤S1中得到的测序数据进行质控;S3、对步骤S2中得到的质控后的数据进行两端reads的拼接,获得长序列数据;S4、根据靶标区间前后的载体序列是已知、并且相同的特点,对步骤S3中获得的长序列数据进行分析,然后将靶标区间序列提取出来,进行统计分析,从而可以获得靶标的构建情况;该方法快速精准、成本低廉,可以多样品混合测序,鉴定成千上万个基因编辑载体,只需要1G的数据量即可以满足分析需求,因此,在植物、动物或微生物载体构建中的应用领域具有良好的应用前景。

著录项

  • 公开/公告号CN113528633A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-10-22

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 湖北伯远合成生物科技有限公司;

    申请/专利号CN202110924679.3

  • 发明设计人 吴磊;

    申请日2021-08-12

  • 分类号C12Q1/6869(20180101);

  • 代理机构31253 上海精晟知识产权代理有限公司;

  • 代理人黄小灵

  • 地址 438000 湖北省黄冈市黄州区新港北路19号黄冈光谷联合科技城C9幢1-2层101-104号

  • 入库时间 2023-06-19 12:57:44

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-06-14

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q 1/6869 专利申请号:2021109246793 申请日:20210812

    实质审查的生效

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