一种马铃薯M病毒基因组全序列及其应用

摘要

本发明公开了一种马铃薯M病毒基因组全序列及其应用。核酸分子的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示或其反义序列。应用为所述的核酸分子用于制备检测马铃薯M病毒的引物、探针或试剂盒，或用于制备抗马铃薯M病毒的抗体。发明人通过常规的病样总RNA的提取和利用多对简并引物进行RT‑PCR扩增、测定了侵染云南马铃薯的马铃薯M病毒基因组全序列。分析发现其基因组为线状、单链正义RNA，不含poly(A)全长8530nt，含6个开读框（ORF），具香石竹潜隐病毒属（Carlavirus）典型结构特征。其中病毒编码的223kDa、25kDa、12 kDa、7 kDa、34 kDa（外壳蛋白）、11kDa蛋白与其分离物的核苷酸同源性分别低于72%、75.1%、71.6%、59.1%、94.6%、97%，根据病毒株系分类标准，马铃薯M病毒云南马铃薯分离物属于一个远缘株系。