利用谱测量法的微生物的鉴定和结构化分类

摘要

本发明涉及用于通过谱测量法来从一组参考物种中鉴定未知微生物的方法，包括以下步骤：第一步骤，用于进行对参考物种进行分类的模型的监督学习；第二步骤，用于预测要鉴定的未知微生物，其包括：获取未知微生物的光谱；以及应用预测模型作为所述光谱和分类模型的函数，从而推断未知微生物所属的至少一种微生物类型。利用结构化多类SVM算法来计算分类模型，其中将该结构化多类SVM算法应用于参考物种在进化和/或临床表型方面的树状层级表示的节点，并且该结构化多类SVM算法包括包含对树的节点之间的邻近性进行量化的所谓的“损失”函数的余量的约束。