用一粒稻谷鉴定籼稻和粳稻的分子标记方法

摘要

本发明属于生物类型鉴别技术领域，具体为一种利用一粒稻谷（或稻米）和插入或缺失（InDel）分子标记来鉴定籼稻和粳稻的方法。本发明从一粒稻谷中提取DNA，利用籼稻93-11和粳稻日本晴的全基因组DNA序列对比而获得的40对特异InDel引物，对水稻种子中提取的DNA进行片段扩增、电泳分离以及电泳图谱的分析来鉴定该水稻样本的籼、粳稻特性。具体而言，以一粒稻谷中提取的DNA为模板，利用40对InDel引物组合，基于聚合酶链式反应和琼脂糖电泳获得的分子指纹图谱进行分析和统计，根据样本40个InDel位点上的93-11基因型和日本晴基因型分子指纹计算出的基因频率（F_i或F_j），确定被测水稻种子（样品）的籼稻或粳稻特性。本发明仅需检测一粒种子的样品便可获得结果，方法简便快捷，鉴定准确，具有良好的推广应用前景。