筛选候选插入片段的方法和系统

摘要

本发明提出了一种筛选候选插入片段的方法，所述插入片段用于改造待测样本核酸序列。该方法包括：基于用于改造待测样本核酸序列的候选基因，确定初始基因编码区序列；对所述初始基因编码区序列进行同义密码子替换，以便获得由多个候选编码区序列构成的候选编码区序列集合；将所述候选编码区序列与自身、宿主基因组和病毒基因组进行比对，并确定同源性高风险区域，以便对所述候选编码区序列进行同源性风险评分；和基于所述同源性风险评分，在所述候选编码区序列集合中确定优选编码区序列子集。