基于病原微生物宏基因组的多种菌群间Granger因果分析方法

摘要

本发明公开了基于病原微生物宏基因组的多种菌群间Granger因果分析方法，其原理为：对获取的病原微生物宏基因组数据进行聚类分析并划分出每一个菌种，核算出每个菌种在疾病发展相应时间节点的物种丰度，然后对每个时间节点建立每组变量的时间序列并进行修正，最后对修正后的数据进行Granger因果分析，找到主要致病菌。利用高通量测序平台鉴定出多种细菌，然后结合Granger因果分析方法找出这些细菌之间的因果作用关系，为从致病微生物样本中找出一种或几种致病菌提供一个快捷的鉴别方法，更快地协助临床医师进行分析判断以实现临床诊断。