基于高通量测序技术比较雄性和雌性黑貉肠道菌群间的差异

摘要

性别不同导致肠道微生物组成和多样性存在差异,肠道微生物影响宿主的营养和免疫功能。貉是一种重要的经济动物,但是不同性别貉的肠道微生物的差异尚未见报道。通过比较冬毛期雌貉与雄貉肠道微生物的差异,探究性别对冬毛期貉肠道微生物的影响。试验于2月份,在同一饲养场采集了24只(雌雄各半)日粮及年龄相同、健康的冬毛期黑貉的新鲜粪便,基于Illumina Miseq平台进行16S扩增子测序。结果表明,雌貉肠道菌群的观测物种数显著高于雄貉,Shannon指数和ACE指数虽然高于雄貉,但是差异并不显著;在门水平上,雌貉和雄貉粪便均以厚壁菌门、拟杆菌门和变形菌门为主,各菌门在组间均无显著差异。在属水平上,Streptococcus、Bacteroides、Phascolarctobacterium、Lactobacillu、Blautia和Alloprevotella等在雌貉与雄貉粪便菌群中均占优势地位。各菌属在组间均无显著差异;雌貉与雄貉肠道菌群的群落结构差异不显著;功能预测发现,碳水化合物代谢、脂质代谢和能量代谢等功能在性别间存在显著差异。因此,冬毛期雌貉与雄貉的肠道微生物间存在差异。