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通过靶向集落刺激因子进行的青光眼和视神经病变的治疗

摘要

本发明提供了用于治疗眼部神经性疾病的组合物和方法。

著录项

  • 公开/公告号CN112423780A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-02-26

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 诗彭斯眼科研究所公司;

    申请/专利号CN201980030208.9

  • 发明设计人 J·闵;K-S·曹;陈东方;

    申请日2019-03-05

  • 分类号A61K38/17(20060101);A61K38/18(20060101);A61K38/19(20060101);

  • 代理机构72002 永新专利商标代理有限公司;

  • 代理人过晓东

  • 地址 美国马萨诸塞州

  • 入库时间 2023-06-19 10:00:31

说明书

相关申请的交叉引用

本申请要求2018年3月5日递交的美国临时申请62/638,884号的优先权,该申请的全部内容通过引证在此并入全文。

联邦赞助研究声明

本发明收到国家眼科研究所编号为R01 EY025259的政府支持。政府享有本发明的某些权利。

技术领域

本发明涉及眼部疾病。

背景技术

青光眼是一组眼部疾病,与眼压升高、视网膜神经节细胞死亡和视神经变性有关。青光眼是全世界不可逆转失明的主要原因。治疗方法仅限于降低眼压(IOP),这可以减缓疾病的进展,但不能阻止疾病的发展。

发明内容

本发明提供了组合物和方法,这些组合物和方法可以解决导致失明的基本潜在缺陷(独立于高眼压或与高眼压相关联)。

因此,通过对眼睛局部施用集落刺激因子-1(CSF1)或其受体抑制剂来实施治疗受试者中的视神经病变的方法。例如,所述抑制剂是一种抗体。或者,通过对眼睛局部施用集落刺激因子-2(CSF2)蛋白质或多肽来实施该方法。

受试者被诊断为青光眼,或被确定易患青光眼或有发展青光眼的风险,例如,受试者的眼压(IOP)尚未升高。因此,该组合物和方法对于该疾病的早期治疗特别有价值。

在某些实施方案中,一种用于治疗受试者中的视神经病变的方法,其包括对眼睛局部施用集落刺激因子-1(CSF1)或其受体抑制剂,或通过对眼睛局部施用集落刺激因子-2(CSF2)蛋白质或多肽。在某些实施方案中,受试者被诊断为青光眼。在某些实施方案中,经玻璃体内给药抑制剂或多肽。在某些实施方案中,抑制剂包含特异性结合到CSF1或CSF1受体的抗体。

在某些实施方案中,一种预防或治疗受试者视神经病变的方法包括对眼睛局部施用一种药物组合物,所述药物组合物包含治疗有效量的集落刺激因子-1(CSF1)或其受体抑制剂和集落刺激因子-2(CSF2)多肽,从而预防或治疗视神经病变。在某些实施方案中,集落刺激因子-1(CSF1)或其受体的抑制剂和集落刺激因子-2(CSF2)蛋白或多肽重组蛋白抑制小胶质细胞活化。在某些实施方案中,集落刺激因子-1(CSF1)或其受体的抑制剂和集落刺激因子-2(CSF2)蛋白或多肽重组蛋白保护视网膜神经节细胞(RGCs)的丧失和视觉功能。在某些实施方案中,集落刺激因子-1(CSF1)或其受体的抑制剂和集落刺激因子-2(CSF2)蛋白或多肽重组蛋白抑制小胶质细胞活化,保护视网膜神经节细胞(RGCs)和视觉功能的丧失。在某些实施方案中,集落刺激因子-1(CSF1)或其受体抑制剂包括抗体、抗体片段、适体、小分子、反义寡核苷酸、siRNA试剂、Fab、Fab′、F(ab′)2片段、Fv片段、单链抗体、抗体模拟物、蛋白样体、细胞因子、酶或其组合。在某些实施方案中,所述药物组合物包含抗CSF1抗体和CSF2重组肽。在某些实施方案中,所述药物组合物包含抗CSF1受体抗体和CSF2重组肽。在某些实施方案中,所述药物组合物包含抗CSF1抗体和抗CSF1受体抗体。在某些实施方案中,所述药物组合物包括抗CSF1抗体、抗CSF1受体抗体和CSF2多肽。在某些实施方案中,所述药物组合物包含CSF1抗体抑制剂和/或CSF1受体抑制剂和/或CSF2多肽。

在某些实施方案中,药物组合物包括治疗有效量的集落刺激因子-1(CSF1)或其受体的抑制剂和集落刺激因子-2(CSF2)蛋白或多肽。在某些实施方案中,集落刺激因子-1(CSF1)或其受体抑制剂包括抗体、抗体片段、适体、小分子、反义寡核苷酸、siRNA试剂、Fab、Fab′、F(ab′)2片段、Fv片段、单链抗体、抗体模拟物、蛋白样体、细胞因子、细胞因子拮抗剂、细胞因子抑制剂、细胞内因子、酶或其组合。

在某些实施方案中,本发明涉及抑制小胶质细胞活化的方法,该方法包括对受试者给药集落刺激因子-1(CSF1)或其受体的抑制剂,或者对眼部局部给药集落刺激因子-2(CSF2)蛋白或多肽。在某些实施方案中,所述受试者被诊断患有青光眼。在某些实施方案中,所述集落刺激因子-1(CSF1)抑制剂、集落刺激因子-1(CSF1)受体抑制剂或者集落刺激因子-2(CSF2)多肽经玻璃体内给药。在某些实施方案中,集落刺激因子-1(CSF1)或其受体抑制剂包括抗体、抗体片段、适体、小分子、反义寡核苷酸、siRNA试剂、Fab、Fab′、F(ab′)2片段、Fv片段、单链抗体、抗体模拟物、蛋白样体、细胞因子、细胞因子拮抗剂、细胞因子抑制剂、细胞内因子、酶或其组合。

在某些实施方案中,集落刺激因子-1(CSF1)或集落刺激因子-1(CSF1)受体的抑制剂被配制用于眼部给药。在某些实施方案中,集落刺激因子-1(CSF1)抑制剂被配制用于眼部给药。在某些实施方案中,集落刺激因子-2(CSF2)多肽或者蛋白被配制用于眼部给药。

在某些实施例中,所述抑制剂或者多肽经玻璃体给药。示例性的CSF1或者CSF1受体抑制剂包括对CSF1或者CSF1受体具有特异性的抗体。例如,CSF1抑制剂被配制用于眼部给药。

作为选择,或者与CSF1治疗相结合,该治疗还包括将CSF2多肽或者蛋白配制用于眼部给药。

可以预计,这里公开的每种实施方案都可以适用于其他公开的实施方案中。因此,这里公开的各种各样元素的所有结合都被包括在本发明的范围内。

从下面关于优选的实施方案的描述和所附权利要求书中,本发明的其他特点及优势将会显而易见。除非另有定义,这里使用的所有技术和科学术语与本发明所述技术领域的普通技术人员的惯常理解相同。尽管与这里公开的相似或者等同的方法和材料也可以被用于本发明的实践已经实验中,但是下面描述了最适合的方法和材料。这里引用的所有公开的外国专利及专利申请通过引证在此全部并入本文。这里引用的附录号所示的Genbank和NCBI文件通过引证在此全部并入本文。这里引用的其他公开的参考文献、文件、手稿或者科学刊物通过引证在此全部并入本文。再出现矛盾的情况下,以本说明书(包括定义)为准。另外,这里提到的材料、方法和实施例只起到解释说明的作用,不能作为对本发明的限制。

附图说明

图1A-1C是正常小鼠(图1A;参照)和微珠注射后3天(3D MB)和7天(7D MB)小鼠(分别是图1B和图1C)视网膜切片上CSF1表达的图像。图1D是一个条形图,显示了在小鼠正常视网膜(参照)和在微珠注射后3(3)和7(7)天后获得的视网膜中检测到的CSF1 mRNA水平的相对倍数变化。缩写:ONL(外核层);OPL(外丛状层);INL(内核层);IPL(内丛状层);GCL(神经节细胞层)。**表示P值<0.001。这些附图(图1A-1D)显示了CSF1在正常视网膜和青光眼视网膜中的表达。

图2A是一系列代表性图,显示了正常小鼠视网膜切片(对照)和微珠注射后7(MB7D)和14(MB 14D)天后青光眼小鼠视网膜切片。图2B是一个条形图,显示了用RT-PCR测定的对照组和青光眼视网膜中CSF2 mRNA水平的定量。图2C是代表性蛋白质印迹结果的照片,显示对照组和青光眼视网膜中CSF2的蛋白质水平,β-肌动蛋白的蛋白质水平作为负荷参照。图2D是一个柱状图,显示在正常视网膜和微珠注射7天和14天后又与正常视网膜均一化的青光眼视网膜中CSF2蛋白水平的量化。*和***表示P值<0.05和0.001。GCL=神经节细胞层;IPL=内丛状层;INL=内核层;OPL=外丛状层;ONL=外核层。这些附图(图2A-D)显示了在正常视网膜和青光眼视网膜中的CSF2的表达。

图3A是一个线状图,显示了在玻璃体内注射CSF1R Ab、CSF2、CSF1R Ab+CSF2或注射参照载体3天和7天后,基线水平的眼压(IOP)和注射完成42天/6周后的眼压(IOP)水平。图3B是一个条形图,显示青光眼的正暗视阈值反应(pSTR)与对侧正常眼的比率。图3C是一个条形图,显示出OMR的对比度灵敏度(CS)。图3D是一个条形图,显示对照组(Ctr)、载体组(Veh)和CSF1R Ab、CSF2和CSF2+CSF1 Ab治疗组的视网膜神经节细胞(RGC)密度。注意Ctr组是未受伤的眼睛。图3E-3G是注射微球后6周Brn3a+RGCs(红色)的显微照片。在这些图中(图3A-G),“#”和“*”分别代表与对照组和载体组的统计分析。*,**和***分别表示P值<0.05、0.01和0.001。#、##和###分别表示P值<0.05、0.01和0.001。这些附图(图3A-3G)说明在本领域内已知的人类青光眼小鼠模型(微珠诱导)中,调节CSFs可保护视网膜功能、视觉表现和神经元丢失。

图4A和4B是显示青光眼SPF和无菌小鼠的细胞因子谱图。用鲁米尼分析法,在眼压(IOP)升高后的第1、2和8周,对无特定病原体(SPF)和无菌(GF)小鼠视网膜中的(图4A)集落刺激因子1(CSF1)和(图4B)CSF2的血清水平进行定量。注意与SPF小鼠相比,青光眼GF小鼠中CSF1水平的持续下调节和CSF2水平持续上调节。

图5A和5B是图表,显示了在微珠(MB)注射的小鼠中CSF1/CSF1R表达的上调。qPCR定量的结果表明,在微珠诱导的眼压升高后,小鼠视网膜中CSF1(图5A)和CSF1R(图5B)的表达上调。

图6A、6B和6C是一系列的图表和蛋白质印迹(Western blot),显示在MB注射的小鼠中CSF2表达的下调节。qPCR(图6A)和蛋白质印迹(图6B,6C)定量结果显示,MB诱导的眼压升高后,小鼠视网膜CSF2和CSF2R表达下调

图7是示出实验设计的示意图。假设通过使用CSF1R抗体(CSF1R-Ab)抑制CSF1和/或促进CSF2信号传导保护RGC免受青光眼损害。实验组分为四组:注射MB诱导高眼压后,分别给予载体(PBS)、CSF1R-Ab、CSF2或CSF1R+CSF2治疗。

图8是显示所有组小鼠眼内压(IOP)水平的图表。在整个过程中监测眼压水平。所有实验组的眼压水平从基线10mmhg增加到16mmhg以上。

图9是示出在MB注入之后通过处理CSF1RAb和/或CSF2而降低的RGC损失的图。对照组(Ctr)小鼠和青光眼(MB注射)小鼠接受载体、CSF1RAb、CSF2和CSF1RAb+CSF2治疗后的RGC计数。

图10是图表,显示了MB注射之后,用CSF1RAb/CSF2治疗增加的pSTR。在注射MB之前(Ctr)、注射后第4周(G4w)和第6周(G6w),分别用载体、CSF1RAb、CSF2或CSF1RAb+CSF2治疗小鼠,评估MB诱导的青光眼小鼠的pSTR振幅。

图11A和11B是图标,表明注射MB后使用CSF1RAb/CSF2治疗可以增强视觉功能。MB诱导的青光眼小鼠在注射MB前(Ctr)、注射4周(G4w)后和注射6周(G6w)后接受载体、CSF1RAb、CSF1RAb或CSF1RAb+CSF2治疗后的视觉对比敏感度和视力的评估。

图12是一种图标,显示了高眼压(IOP)诱导的1ba-1表达。在MB注射第0天、第3天、第7天和第14天,对小鼠视网膜进行1ba-1水平的qPCR定量检测。

图13是蛋白质印迹和图标,显示了高IOP活化雌性胶质细胞。在MB注射第0天、第3天、第7天和第14天,对小鼠视网膜进行活化的雌性胶质细胞标记物、GFPA表达的蛋白质印迹定量分析。

具体实施方案

小胶质细胞的激活在青光眼神经退行性变的进展中起着关键作用。集落刺激因子1(CSF1)和集落刺激因子2(CSF2)通过调节小胶质细胞功能参与青光眼神经元的丢失。青光眼小鼠的CSF1水平上调,CSF2表达下调。此外,在青光眼小鼠模型中加入CSF2重组蛋白或通过玻璃体内注射抗CSF1或抗CSF1受体抗体中和CSF1可以显著抑制小胶质细胞的激活,并保护青光眼小鼠模型中视网膜神经节细胞(RGCs)和视觉功能的丧失。数据表明,调节脑脊液通路对青光眼和/或视神经病变患者的临床益处是有用的。

集落刺激因子-1(CSF-1)主要以蛋白多糖的形式存在于循环中,其生物活性浓度约为10ng/mL,由多种间充质细胞和上皮细胞组成。在许多不同的疾病中,包括感染、癌症和慢性炎症性疾病中,无论病因如何,血液循环中的水平都会增加。CSF1控制单核吞噬细胞的存活、增殖和分化,并调节雌性生殖道细胞。CSF1在卵巢癌、子宫内膜癌、乳腺癌、髓系和淋巴组织中也可能发挥自分泌和/或旁分泌作用。CSF1水平在妊娠期间也在循环中升高,并有助于胎盘形成。在小鼠和人类中,有一个围产期组织和循环CSF1激增。在炎症反应中,CSF1也可能由招募的巨噬细胞自身产生,尽管至少在小鼠中,大多数巨噬细胞不产生CSF1,并且在缺乏蛋白质的情况下经历细胞死亡。在正常的稳态条件下,CSF1的产生通过CSF1受体(CSF1R)的受体介导的内吞作用以及细胞内的破坏来平衡CSF1的产生。

粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子,又称GM-CSF和CSF2,是巨噬细胞、T细胞、肥大细胞、自然杀伤细胞、内皮细胞和成纤维细胞分泌的单体糖蛋白,能起细胞因子的作用。CSF2控制粒细胞和巨噬细胞的产生、分化和功能。天然存在的CSF2的药物类似物被称为沙格司亭(Sargramostim)和莫拉司亭(Molgramostim)。CSF2可以作为一种药物来刺激化疗后白细胞的产生。它也可以作为HIV感染者的疫苗佐剂。

集落刺激因子3(CSF3)是一种糖蛋白,它刺激骨髓产生粒细胞和干细胞并将其释放到血液中。在功能上,它是一种细胞因子和激素,一种集落刺激因子,由许多不同的组织产生。天然存在的CSF3的药物类似物被称为非格司亭(filgrastim)和来格司亭(lenograstim)。CSF3还能刺激中性粒细胞前体和成熟中性粒细胞的存活、增殖、分化和功能。

CSF1和CSF2在调节单核细胞/巨噬细胞的活动中起主要作用,而CSF2和CSF3则调节粒细胞(中性粒细胞)。巨噬细胞活化后极化为M1和M2亚型。CSF2促进M1表型,分泌促炎细胞因子,如TNF-α和IL-12,并通过刺激免疫反应增强对细菌或肿瘤的防御。相反,CSF1刺激M2表型,分泌抗炎细胞因子,促进组织修复和血管生成。

CSF1和CSF2的受体属于酪氨酸激酶家族,激活PI-3/AKT、MAPK、STAT通路的下游通路,以传导细胞存活/增殖、分化和激活信号。

在本发明之前,并没有认识到CSF1和CSF2对于青光眼和视神经退行性疾病的作用。

数据(图1A-1D,图2A-1D,图3A-3F,图5A,5B,图9,图10,图11A,11B)显示CSF1或者CSF1受体阻断剂以及CSF2蛋白给药/增强对人青光眼小鼠模型视网膜神经节细胞变性和视觉表现的保护作用。这些数据揭示了青光眼神经损伤发病机制的新见解,并展示了通过玻璃体内注射阻断CSF1/CSF1受体活性和/或给予CSF2重组蛋白的治疗青光眼患者的潜力。在眼科门诊中,向玻璃体多次注射此类药物是一种常见且低风险的做法。青光眼是最常见的视神经病变。所述组合物和方法还可用于治疗其它形式的视神经病变或用于脑和脊髓中类似的神经退行性病变。

本文所述的研究表明,在没有微生物区系的情况下饲养的小鼠(无菌小鼠)不会在眼压升高后发生视网膜神经节细胞(RGC)损伤。此外,数据表明,在无菌小鼠中,集落刺激因子1(CSF1)的表达下调,而CSF2的表达上调。然后进行研究以确定CSF1和CSF2是否在青光眼RGC损失中起相反的作用。本文报道了CSF1和CSF2在标准小鼠青光眼模型中的表达和参与。

将微球(MB)注入成年B6小鼠前房,诱导高眼压。免疫组化染色和定量聚合酶链反应(qPCR)检测MB注射后不同时间点CSF1/2及其受体的表达。对高眼压小鼠玻璃体内注射CSF2和/或CSF1中和抗体。在视网膜全层中用抗brn3a染色法标记RGC。

已经发现,注射MB后2周视网膜中CSF1表达上调,CSF2表达下调。数据还显示,与盐水处理的对照小鼠相比,给予CSF2或CSF1特异性抗体(例如中和抗体)可减少或减轻青光眼RGC的损失。CSF1受体与小胶质细胞和RGCs相关,而CSF2受体则由Muller细胞和RGCs表达。

这些数据表明,CSF1和CSF2在眼压升高导致青光眼性RGC变性的小胶质细胞和Muller细胞激活中起相反的作用。这些发现表明,抑制CSF信号和/或增强CSF信号可以有效地减少或防止青光眼等视神经病变患者的RGC丢失和视力丧失。

UniProt KB-P09603(CSF1_HUMAN)如下所示(SEQ ID NO:1):

人集落刺激因子1受体(CSF1-R)氨基酸序列AAH47521.1如下所示(SEQ ID NO:2):

SEQ ID NO:2;GenBank登录号AAH47521.1,通过引证在此全部并入本文。

CSF1-R的示例性标志性残基、结构域和片段包括但不限于残基28-85(免疫球蛋白样结构域)、残基207-293(免疫球蛋白样结构域)、残基209-290(免疫球蛋白样结构域)、残基299-400(干细胞因子受体(SCFR)的第四免疫球蛋白(Ig)样结构域),残基401-495(免疫球蛋白样结构域)、542-914(蛋白激酶,催化结构域)或残基588到591、594、596、614、616、647、663到666、778、782、783、785和795和796(ATP结合位点)。CSF1-R蛋白的片段长度小于全长蛋白质的长度,例如,片段长度至少为3、4、5、6、7、8、9、10、20、30、40、50、100、200或更多残基,但在上述CSF1-R的情况下,短于例如972个残基。

人CSF1-R核酸序列BC047521.1(起始密码子和终止密码子加下划线)(SEQ ID NO:3):

CSF2(也叫做GM-CSF,被描述在NP_000749.2中,粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子前体;通过引证在此全部并入本文)的序列如下所示(SEQ ID NO:4):

一种针对细胞因子集落刺激因子1(CSF1;CSF-1;巨噬细胞集落刺激因子;M-CSF)的人源化免疫球蛋白(Ig)G2单克隆抗体(mAb),具有潜在的免疫调节和抗肿瘤活性,抗CSF1单克隆抗体PD-0360324靶向、结合并中和CSF1。这就阻止了CSF1与其受体CSF1R(CD115;M-CSFR)的结合,后者在各种免疫细胞上表达,如单核细胞和巨噬细胞。这会阻止这些细胞中CSF1R的激活和CSF1R介导的信号传导,从而抑制单核细胞的分化,阻断巨噬细胞的活动,减少炎症介质的产生,从而减轻炎症。通过阻断肿瘤微环境中CSF1R依赖性肿瘤相关巨噬细胞(TAM)的活性和增殖,PD-0360324降低TAM介导的免疫抑制,减少调节性T细胞(Tregs),重新激活免疫系统,并通过增加细胞毒性T细胞的浸润来改善抗肿瘤细胞反应。TAMs在免疫抑制、肿瘤细胞增殖和生存中起关键作用。CSF-1在单核细胞和巨噬细胞的增殖、分化和存活中起着重要的调节作用。

示范性抗体包括可从研发系统(明尼苏达州明尼阿波利斯市)获得的抗体,例如,中和的小鼠M-CSF抗体;Cat#:MAB416-SP,或eBioscience(购自ThermoFischer公司);CD115(c-fms)单克隆抗体;Cat#:AFS9或Peprotech(美国新泽西州洛基希尔08553);重组鼠GM-CSF;Cat#:315-03。

一种口服生物可利用的集落刺激因子1受体抑制剂(CSF-1R;CSF1R),具有潜在的抗肿瘤活性,CSF1R抑制剂BLZ945(4-[2((1R,2R)-2-羟基环己基氨基)-苯并噻唑-6-酰氧基]-吡啶-2-羧酸甲酰胺)选择性结合到肿瘤相关巨噬细胞(TAM)上表达的CSF1R上,阻断CSF1R的活性,抑制CSF1R介导的信号转导途径。这会抑制TAM的活性和增殖,并重新编程现有TAM的免疫抑制性质。总之,这减少了肿瘤微环境中TAM介导的免疫抑制,重新激活免疫系统,并改善了T细胞介导的抗肿瘤细胞反应。CSF1R,也称为巨噬细胞集落刺激因子受体(M-CSFR)和CD115(分化簇115),是其配体集落刺激因子1(CSF1)的细胞表面受体;该受体在肿瘤微环境中被TAMs过度表达,在免疫抑制和诱导肿瘤细胞增殖中起重要作用。

酪氨酸激酶受体集落刺激因子1受体(CSF1R;CSF-1R;C-FMS;CD115;M-CSFR)的另一种抑制剂(具有潜在的抗肿瘤、巨噬细胞检查点抑制性和免疫调节活性)是DCC-3014,其靶向并结合在单核细胞、巨噬细胞和成骨细胞上表达的CSF1R,并抑制CSF1R配体集落刺激因子-1(CSF-1)和白细胞介素-34(IL-34)与CSF1R的结合,从而阻止这些细胞z红CSF1R的激活和CSF1R介导的信号传导。这可以阻止巨噬细胞和单核细胞产生炎症性调节因子,并减少炎症。DCC-3014通过阻断肿瘤微环境的募集和CSF1R依赖的肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的活性,抑制巨噬细胞的免疫调节活性,增强T细胞浸润和抗肿瘤T细胞免疫应答,从而抑制肿瘤细胞的增殖。TAMs在肿瘤微环境中起关键作用,并允许免疫抑制;TAMs促进炎症、肿瘤细胞增殖、血管生成、侵袭性和存活率。

在癌症患者中进行临床阶段试验的CSF1受体的其他抑制剂的实例包括:佩西达替尼(PLX3397,PLX108-01),PLX7486,ARRY-382,JNJ-40346527,BLZ945,Emactumab(RG7155),AMG820,IMC-CS4(LY3022855),MCS110,GW-2580,格列卫(甲磺酸伊马替尼)。(Cannarile,Michael A et al.“Colony-stimulating factor 1receptor(CSF1R)inhibitors incancer therapy”Journal for immunotherapy of cancer vol.5,1 53.18Jul.2017,doi:10.1186/s40425-017-0257-y)。

PLX73086(AC708)是CSF1R的一种小分子抑制剂,可导致CSF1R活化降低,并可通过肿瘤相关巨噬细胞的减少恢复对血管生成抑制的抵抗力(Lyons,Y.A.et al.,Oncotarget.2017Aug 24;8(57):96496-96505.doi:10.18632/oncotarget.20410.收集日期2017年11月14号)。西奥罗尼(Chiauranib)(CS2164)是一种多激酶抑制剂,可抑制AURKB、CSF-1R、VEGFRs、KIT和PDGFRA,导致肿瘤生长和血管生成减少(Zhou,Y.et al.,CancerSci.2017Mar;108(3):469-477.doi:10.1111/cas.13141.2017年3月7日电子公开)。Sprycel(达沙替尼)是SRC蛋白激酶家族、BCR-ABL和ABL的抑制剂,对其他激酶(包括KIT、DDR1/2、PDGFRA/B和EPHA2)具有额外的活性,这些激酶可阻止细胞生长(Kothiwale S.etal.,Drug Discov Today.2015Feb;20(2):255-61.doi:10.1016/j.drudis.2014.09.025.2014年10月7日电子公开)。DCC-3014抑制CSF1R,与其他药物联合使用可能导致抗肿瘤免疫反应增强(Cancer Res 2016;76(14Suppl):Abstract nr 4889)。Debio 0617B是SRC、JAK和ABL、III类激酶、CSF1R、FLT3、KIT和PDGFR以及V类激酶VEGFR1/2/3的多激酶抑制剂,其可能导致Stat3和Stat5信号的抑制,从而抑制肿瘤细胞的生长和转移(Murone,M.et al.,Mol Cancer Ther.2016Oct;15(10):2334-2343.2016年7月20日电子公开)。Dovitinib(TKI258)靶向多受体酪氨酸激酶,包括Flt3、c-Kit、CSF1R、FGFR 1-4、VEGFR1-3和PDGFRα和β,可能导致肿瘤生长降低((Lesca E.,et al.,J Mol Biol.2014Nov 11;426(22):3744-3756.doi:10.1016/j.jmb.2014.09.004.2014年9月16日电子公开;AndréF.et al.,Clin Cancer Res.2013Jul 1;19(13):3693-702.doi:10.1158/1078-0432.CCR-13-0190.2013年5月8日电子公开)。依麻特珠单抗(emactuzumab)(RG7155)是一种抑制CSF1R二聚化的单克隆抗体,导致配体依赖性和非配体依赖性信号降低((Ries C.H.etal.,Cancer Cell.2014Jun 16;25(6):846-59.doi:10.1016/j.ccr.2014.05.016.2014年6月2日电子公开)。FF-10101是Flt3的第二代不可逆抑制剂,包括内部串联重复(Flt3-ITD)和已知的耐药突变(D835Y、Y842C、Y842H或F691L),还抑制Kit和Csf1r(Fms)(Yamaura T.etal.,Blood.2018Jan 25;131(4):426-438.doi:10.1182/blood-2017-05-786657.2017年11月29日电子公开)。GW2580是CSF-1R的ATP-竞争性选择性肿瘤抑制因子可导致肿瘤细胞生长抑制。(Ryder M.et al.,PLoS One.2013;8(1):e54302.doi:10.1371/journal.pone.0054302.2013年1月23日电子公开)。JNJ-40346527是CSF1R的小分子抑制剂(von Tresckow B.et al.,Clin Cancer Res.2015Apr 15;21(8):1843-50.doi:10.1158/1078-0432.CCR-14-1845.2015年1月27日电子公开)。Ki20227抑制CSF1R,这可能导致CSF依赖性细胞生长降低(Ohno H.等人,分子癌症治疗。2006年11月;5(11):2634-43)。来他替尼(CEP-701)(Hexner E.O.et al.,Blood.2008Jun 15;111(12):5663-71。2007年11月5日电子公开)。利尼伐尼(ABT-869)是一种受体酪氨酸激酶抑制剂,对FLT1(VEGFR1)、CSF-1R、KDR(VEGFR2)、FLT3和KIT具有特异性,可能导致对细胞增殖、肿瘤生长的抑制作用并使肿瘤消退(Albert D.H.et al.,Mol Cancer Ther.2006Apr;5(4):995-1006)。雷德帕斯(米哚妥林)是一种多激酶抑制剂((Ashman L.K.et al.,Expert Opin Investig Drugs.2013Jan;22(1):103-15.doi:10.1517/13543784.2013.740010.2012年11月6日电子公开)。Tasigna(尼罗替尼)抑制几种酪氨酸激酶,包括BCR-ABL、PDGFR、KIT、DDR和CSF-1R(Blay J.Y.等人,Semin Oncol。2011年4月;38补遗1:S3-9。《美国肿瘤学杂志》2011年1月10日第1053.01号文件)。培西达替尼(Pexidartinib,PLX3397)抑制多种受体酪氨酸激酶,包括KIT、CSF1R、FLT3和FLT3/ITD(Smith C.C.et al.,Cancer Discov.2015Jun;5(6):668-79.doi:10.1158/2159-8290.CD-15-0060.2015年4月6日电子公开)。PLX7486结合并抑制CSF1R、TRKA、TRKB和TRKC。Nexavar(索拉菲尼)是一种多激酶抑制剂,对多种激酶具有活性,包括RAF激酶、VEGFR2、VEGFR3、PDGFRβ、KIT、FLT3、RET和CSF1R((Ullrich K.et al.,Br JHaematol.2011Nov;155(3):398-402.doi:10.1111/j.1365-2141.2011.08685.x.2011年4月22日电子公开)。Sutent(舒尼替尼)抑制KDR(VEGFR2)、PDGFR、c-KIT、FLT3、RET和CSF1R(Subbiah V.et al.,J Hematol Oncol.2014Aug 1;7:52.doi:10.1186/s13045-014-0052-x)。

在某些实施方案中,CSF1R抑制剂包含PLX3397(Tahmasebi F.et al.,J CellBiochem.2019Jan 10.doi:10.1002/jcb.28344),GW-2580(Gerber Y.N.et al.,FrontCell Neurosci.2018;12:368.),BLZ-945(Pyonteck S.M.等人,国家医学院。2013年10月;19(10):1264-72。doi:10.1038/nm.3337)或其组合。在某些实施方案中,CSF1R中和抗体包括:RG-7155、FPA-008、M279(公共来源,例如,来自AMGEN公司)或其组合。

特异性结合到CSF1或其受体的抗体,抑制CSF1分子的功能或活性。抗体可通过本领域已知的任何方法产生,以产生SEQ ID No:1或2。在某些实施方案中,其抗体或片段,特异性地结合到与SEQ ID NO:1或2分别具有至少50%序列一致性的的CSF1肽或CSF1R上。在某些实施方案中,抗体或其片段特异性地结合到分别与SEQ ID NOS:1或2具有至少75%序列一致性的CSF1肽或CSF1R上。在某些实施方案中,抗体或其片段特异性地结合到分别与SEQ ID NOS:1或2具有至少95%序列一致性的CSF1肽或CSF1R上。在某些实施方案中,抗体或其片段特异性结合到SEQ ID NOS:1或2中的表位上。

在某些实施方案中,与CSF2相比,CSF1及其受体的抑制剂优先抑制CSF1及其受体。在某些实施方案中,与CSF2的活性或功能相比,CSF1抑制剂或CSF1R抑制剂对CSF1的表达和/或活性和/或功能的抑制能力是CSF2的约1倍。在某些实施方案中,与CSF2活性或功能相比,CSF1抑制剂或CSF1R抑制剂对CSF1的表达和/或活性和/或功能的抑制能力使CSF2的约为2倍、3倍、5倍、10倍、20倍、50倍或更多。在某些实施方案中,与CSF2活性或功能相比,CSF1抑制剂或CSF1R抑制剂对CSF1的表达和/或活性和/或功能的抑制能力是CSF2的至少5%。在某些实施方案中,与CSF2活性或功能相比,CSF1抑制剂或CSF1R抑制剂对CSF1的表达和/或活性和/或功能是CSF2的至少10%、15%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更多。

CSF1和CSF2的活性可通过本领域已知的方法以及本文中详细说明的任何分析方法来确定。例如,mRNA表达,蛋白质表达(图1A-1C,图2A-2D,图5A-5B,图6A-6C),眼压(图3A-3G,图8,图12),细胞因子曲线(图5A,5B),RGC损失(图9),正暗视阈值响应(pSTR)(图10),视觉功能(图11A,11B),lba-1表达(图12),Muller胶质细胞活化(图13)。抑制剂是否特别抑制CSF1或其受体而不是CSF2,可以通过类似的试验来确定。例如,CSF1,CSF1R与CSF2的表达式。这些检测可以与常规的临床检查相结合。

在青光眼的实验模型和遗传模型中,通过强调视网膜内神经元活动的ERG技术的变体,可以无创地评估视网膜神经节细胞(RGC)的功能。最好理解的技术是模式视网膜电图(PERG)响应对比度反转光栅或棋盘格,这种技术选择性地依赖于功能性RGC的存在。在青光眼模型中,PERG可以在RGCs组织学损失之前发生改变;PERG的改变可以在中等眼压降低时逆转,或者在中等眼压升高时加重。在特定的亮度刺激条件下,闪光ERG显示可能反映视网膜近端的电活动的成分,并在某些实验性青光眼模型中发生改变(暗视阈值阳性反应,pSTR;负暗视阈值反应,nSTR;明视负反应,PhNR;振荡电位,OPs;多焦ERG,mfERG)(VittorioPorciatti,Exp Eye Res.2015Dec;141:164–170)。

在一些实施方案中,抗原结合结构域是人源化抗体或其片段。“人源化”抗体是一种抗体,其中所有或基本上所有的互补性决定区(CDR)氨基酸残基均来自非人类CDR,且所有或基本上所有框架区(FR)氨基酸残基均来自人类FRs。人源化抗体可任选地包括衍生自人类抗体的抗体恒定区的至少一部分。非人抗体的“人源化形式”是指经过人源化的非人抗体变体,通常是为了降低对人类的免疫原性,同时保持亲本非人抗体的特异性和亲和力。在一些实施方案中,人源化抗体中的一些FR残基被来自非人类抗体(例如,衍生CDR残基的抗体)的相应残基取代,例如,以恢复或改善抗体特异性或亲和力。

在一些实施方案中,抗体的重链和轻链可以是全长的或可以是抗原结合部分(Fab、F(ab′)2、Fv或单链Fv片段(scFv))。在其它实施方案中,抗体重链恒定区选自例如IgGl、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgAl、IgA2、IgD和IgE,尤其选自例如IgGl、IgG2、IgG3和IgG4,更具体地,选择IgGl(例如,人类IgGl)。在另一实施方案中,抗体轻链恒定区域选自例如kappa或lambda,尤其是kappa。

提供的抗体中有抗体片段。“抗体片段”是指一种分子,该分子不包括完整的抗体而是包括完整抗体的一部分,该完整抗体的一部分结合完整抗体能结合的抗原。抗体片段的示例包括但不限于Fv、Fab、Fab、Fab’、Fab′-SH、F(ab’)2;双抗体;线性抗体;可变重链(VH)区域、单链抗体分子(如单链抗体和单域VH单抗体);以及由抗体片段形成的多特异性抗体。在具体实施方案中,抗体是由可变重链区域和/或可变轻链区域(例如单链抗体)组成的单链抗体片段。

在某些实施方案中,所述抗体是单域抗体。单域抗体是包括一个抗体所有或者部分重链可变区或者所有或者部分轻链可变区的抗体片段。在某些实施方案中,单域抗体是人单域抗体。

可以使用各种各样的技术来制备抗体片段,包括但是不局限于,完整抗体的蛋白水解消化以及重组宿主细胞的产生。在一些实施方案中,抗体是重组产生的片段,例如包含并非自然发生的排列的片段,例如具有由合成连接体(例如肽连接体)连接的两个或多个抗体区域或链的片段,和/或可能不是通过酶消化自然产生的完整抗体产生的片段。在某些方面,抗体片段是单链抗体。

在某些实施方案中,抗体或抗体片段对CSF1或CSF1受体具有高结合亲和力。在实施方案中,增加的结合亲和力大于受参考抗原的影响。

在某些实施方案中,基于其抑制CSF1表达或活性的能力来选择CSF1抑制剂。在某些实施方案中,基于其抑制CSF1受体的表达或功能或抑制CSF1与CSF1受体结合的能力来选择CSF1抑制剂。在某些实施方案中,基于所选的进行治疗活性测定的筛选分析来识别的这些潜在治疗剂以测试其治疗活性。在某些实施方案中,治疗活性是抑制小胶质细胞活化、防止视网膜神经节细胞(RGC)的损失和视觉功能。

候选/检测试剂:各种候选试剂,例如CSF1及其受体抑制剂,可用于本发明的筛选方法中,包括任何自然存在的试剂或人工生成的试剂。它们可以是任何化学类别,例如抗体、小分子、蛋白质、肽、小有机化合物、糖、脂肪酸、甾体、嘌呤、嘧啶、核酸和各种结构类似物或其组合。在一些实施方案中,筛选方法利用候选试剂的组合库。组合库可以产生许多类型的化合物,这些化合物可以一步一步合成。这类化合物包括多肽、β-环模拟物、核酸、多糖、磷脂、激素、前列腺素、甾体、芳香族化合物、杂环化合物、苯二氮卓类、低聚N-取代甘氨酸和低聚氨基甲酸酯。化合物的大型组合文库可通过编码合成文库(ESL)方法构建,该方法在Affymax公司的专利申请WO 95/12608,Affymax公司的专利申请WO 93/06121,哥伦比亚大学的专利申请WO94/08051和Pharmacopeia公司的专利申请WO 95/35503和Scripps公司的专利申请WO 95/30642(为了所有目的,这些专利中的每一个都通过引用并入本文中)中有记载。肽库也可以通过噬菌体展示方法生成。例如,见Devlin,W0 91/18980。

候选试剂包括许多化学类别,尽管它们通常是有机化合物(包括小有机化合物),核酸(包括寡核苷酸),肽或抗体。适当的小有机化合物可具有例如大于约40或50但小于约2500的分子量。候选试剂可包含与蛋白质和/或DNA相互作用的功能性化学基团。

候选试剂可从多种来源获得,包括合成或天然化合物库。例如,许多方法可用于各种有机化合物和生物分子的随机和定向合成,包括随机寡核苷酸的表达。或者,以细菌、真菌和动物提取物等形式存在的天然化合物库是可用的或易于生产的。

化学文库:组合化学的发展使人们能够快速而经济地合成成百上千的独立的化合物。这些化合物通常排列在设计用于有效筛选的中等大小的小分子库中。组合方法可以用来产生无偏文库,适用于新化合物的鉴定。此外,可以从具有先前确定的生物活性的单亲化合物衍生出更小、更少样化的文库。

组合化学文库是由化学合成或生物合成产生的各种化合物的集合,通过组合许多化学“构件”,例如试剂,产生。例如,对于给定的化合物长度(即,多肽化合物中的氨基酸的数量),通过以大量组合(并且可能以各种可能的方式)组合一组化学构件(氨基酸)来形成线性组合化学库,例如多肽库。数以百万计的化合物可以通过这种化学构件的组合混合来合成。

“文库”可包含2到50000000个不同的成员化合物。优选地,文库包含至少48种不同的化合物,优选96种或更多种化合物,更优选384种或更多种化合物,更优选10000种或更多种化合物,优选100000多种不同成员和最优选1000000多种不同成员化合物。“多样性”是指一个库中超过50%的化合物具有与库中任何其他成员不同的化学结构。优选地,库中大于75%的化合物具有与集合的任何其他成员不同的化学结构,更优选地大于90%且最优选地大于约99%。

组合化学品库的制备方法是本领域普通技术人员已知的。可以参见,例如,Thompson et al.,Synthesis and application of small molecule libraries(《小分子库的合成与应用》),Chem Rev96:555-600,1996;Kenan et al.,Exploring moleculardiversity with combinatorial shape libraries(《利用组合形状库探索分子多样性》),Trends Biochem Sci 19:57-64,1994;Janda,Tagged versus untagged libraries:methods for the generation and screening of combinatorial chemical libraries(标记库与未标记库:组合化学库的生成和筛选方法),Proc Natl Acad Sci USA(《美国自然科学杂志》).91:10779-85,1994;Lebl et al.,One-bead-one-structurecombinatorial libraries(《一珠一结构组合库》),Biopolymers 37:177-98,1995;Eichler et al.,Peptide,peptidomimetic,and organic synthetic combinatoriallibraries(肽、拟肽和有机合成组合库),Med Res Rev.15:481-96,1995;Chabala,Solid-phase combinatorial chemistry and novel tagging methods for identifying leads(固相组合化学和识别铅的新标记方法),Curr Opin Biotechnol.6:632-9,1995;Dolle,Discovery of enzyme inhibitors through combinatorial chemistry(通过组合化学发现酶抑制剂),Mol.Divers.2:223-36,1997;Fauchere et al.,Peptide and nonpeptidelead discovery using robotically synthesized soluble libraries(《利用机器合成的可溶性库发现肽和非肽先导》),Can J.Physiol Pharmacol.75:683-9,1997;Eichler etal.,Generation and utilization of synthetic combinatorial libraries(《合成组合库的产生和利用》),Mol Med Today 1:174-80,1995;以及Kay et al.,Identification ofenzyme inhibitors from phage-displayed combinatorial peptide libraries(从噬菌体展示的组合肽库中识别酶抑制剂),Comb Chem High Throughput Screen 4:535-43,2001。

还可以使用其他化学品来产生化学多样性文库,这种化学品包括但是不局限于拟肽(PCT公开号WO 91/19735);编码肽(PCT公开号93/20242);随机-生物低聚物(PCT公开号WO 92/00091);苯二氮卓类(美国专利第5288514号);多聚体,如乙内酰脲、苯二氮卓类和二肽类(Hobbs,et al.,Proc.Nat.Acad.Sci.USA,90:6909-6913(1993));乙烯类聚合物多肽(Hagihara,et al.,J.Amer.Chem.Soc.114:6568(1992));具有β-D-葡萄糖支架的非肽拟肽组分(Hirschmann,et al.,J.Amer.Chem.Soc.,114:9217-9218(1992));小化合物库的类似有机合成(Chen,et al.,J.Amer.Chem.Soc.,116:2661(1994));低聚氨基甲酸酯(Cho,etal.,Science,261:1303(1993));和/或肽基磷酸酯(Campbell,et al.,J.Org.Chem.59:658(1994));核酸文库(参见Ausubel,Berger and Sambrook,,均见上文);肽核酸库(参见,例如,美国专利第5539083号);抗体库(参见,例如,沃恩等人,《自然生物技术》,14(3):309-314(1996)和PCT/US96/10287);碳水化合物库(参见,例如,Liang等人,《科学》,274:1520-1522(1996)和美国专利第5593853号);小有机分子库(参见,例如,苯二氮卓类化合物,BaumC&e News,1月18日,第33页(1993年);类异戊二烯(美国专利号:5569588);噻唑烷酮和甲噻嗪酮(美国专利第5549974号);吡咯烷(美国专利第5525735号和5519134);吗啉化合物(美国专利第5506337号);苯二氮卓类(美国专利5288514号);等等。

用于制备组合文库的设备在市场上是可以买到的(例如,357MPS,390MPS,Advanced Chem技术公司,路易斯维尔肯塔基州,Symphony,Rainin,Woburn,Mass.,433AApplied Biosystems,Foster City,California,9050Plus,Millipore,Bedford,Mass.)。此外,许多组合文库本身也是商业化的(例如,见ComGenex,Princeton,N.J.,Asinex,Moscow,Ru,Tripos,Inc.,St.Louis,Mo.,ChemStar,Ltd.,Moscow,Ru,3DPharmaceuticals,Exton,Pa.,Martek Bio sciences,Columbia,Md等)。

本发明的筛选分析适当地包括和体现动物模型、基于细胞的系统和非基于细胞的系统。已识别的基因、变体、片段或其寡肽被用于识别具有治疗意义的试剂,例如通过筛选化合物库或通过各种药物筛选或分析技术以其他方式识别感兴趣的化合物。在这种筛选中使用的基因、等位基因、片段或其寡肽可在溶液中游离、附着在固体载体上、载于细胞表面或位于细胞内。测量将按照以下示例部分中的详细描述进行。

在一些实施方案中,识别候选治疗剂的方法包括使用高通量筛选实验筛选包含特定靶分子的样品。

在另一实施方案中,识别治疗剂的方法包括:(i)使目标分子与候选治疗剂接触;确定(i)该制剂是否调节肽的功能或肽是否与伙伴分子的相互作用;或(ii)该试剂是否调节靶核酸序列的表达和/或功能。

在另一实施方案中,一种识别用于治疗疾病的候选治疗剂的方法包括,培养表达靶分子的分离细胞,向培养的细胞施用候选治疗剂;使靶分子表达相关,与对照细胞比较在存在或不存在候选治疗剂的情况下的活性和/或功能变化,其中基于期望的治疗结果来识别药物。例如,一种药物,它调节目标分子的水平,从而导致疾病状态,或者目标分子调节另一分子的活性或数量,无论是在通路的上游还是下游。在其他的实施例中,实验测量激酶活性。在其他实施例中,该实验测量结合伙伴。在其他实施例中,该分析测量提供期望治疗结果的候选治疗剂的量。

用于诊断和候选药物发现的另一个合适的方法包括将测试样本与表达目标分子的细胞相接触,并检测测试试剂与目标分子、其等位基因或片段或目标分子的表达产物的等位基因或片段的相互作用。

在另一实施方案中,分离样本(例如,来自患者的细胞或液体)并与候选治疗分子接触。对基因及其表达产物进行监控,以确定哪些基因或表达产物受药物调控。

如上所述,本发明的组合物可以以本发明所属技术领域普通技术人员已知的各种方法制备。无论其最初来源或者获得方式是什么,本发明的组合物可以依据其使用目的被配制成合适的剂型。例如,上面描述的核酸和载体可以被配制成用于向组织培养物的细胞中施用的组合物,或者用于向患者或者受试者施用的组合物。本发明的任何药物组合物均可配制而用于制药应用,并且下文中的治疗部分所描述的特定用途中。这些组合物可以药学领域中公知的方式制备,且可藉由多种途径给药,取决于是否需要局部或全身治疗及待治疗区域。给药可以是局部给药(包括眼部给药和粘膜给药,包括鼻内给药、阴道给药和直肠给药)、肺部给药(例如,通过吸入或吹入粉末或气溶胶,包括通过雾化剂;气管内给药、鼻内给药、表皮给药和经皮给药)、眼部给药、口服或胃肠外给药。眼部给药方法可包括局部给药(滴眼液)、结膜下注射、眼周注射或玻璃体腔内注射或经手术放置于结膜囊内的球囊导管或眼内植入物给药。肠外给药包括静脉注射或者输液、动脉内注射或者输液、皮下注射或者输液、腹腔注射或者输液或肌肉注射或者输液;或颅内,例如鞘内或脑室内给药。肠胃外给药可以是单次给药的形式,也可以是,例如,通过连续灌注泵。用于局部施用的药物组合物及制剂可包括经皮贴片、软膏、乳液、乳膏、凝胶、滴剂、栓剂、喷雾剂、液体、粉末等。常见的药物载体、水性、粉末或油性碱、增稠剂等可以是必要的或可取的。

本发明还包括一些药物组合物,所述药物组合物含有这里所描述的多肽、核酸和载体作为活性成分,并且所述活性成分与一种或多种药学上可接受的载体组合。术语药学上可接受的载体,包括任何和所有溶剂、分散介质、涂料、抗菌剂、等渗剂和吸收延迟剂、缓冲剂、赋形剂、粘合剂、润滑剂、凝胶、表面活性剂等,其可用作药学上可接受物质的介质。在制造本发明的组合物时,活性成分通常与赋形剂混合,用赋形剂稀释或以胶囊、片剂、香囊、纸或其他容器的形式封装在此类载体内。当赋形剂用作稀释剂时,它可以是固体、半固体或液体材料(例如生理盐水),其作为活性成分的媒介物、载体或介质。因此,所述组合物可为片剂、药丸、粉末、锭剂、香囊、药膏、酊剂、悬浮液、乳剂、溶液、糖浆、气雾剂(固体或液体介质)、洗剂、乳膏、软膏、凝胶、软硬明胶胶囊、栓剂、无菌注射溶液和无菌包装粉末的形式存在。如本领域已知,稀释剂的类型可根据预期给药途径而变化。所得到的组合物可以包括诸如防腐剂之类的其他试剂。在一些实施方案中,载体可以是或者可以包括基于脂质或聚合物的胶体。在一些实施方案中,载体材料可以是配制成脂质体、水凝胶、微粒、纳米粒子或嵌段共聚物胶束的胶体。如前所述,载体材料可以形成胶囊,并且该材料可以是基于聚合物的胶体。

在一些情况下,局部眼部制剂是溶液、悬浮液、乳霜、软膏、凝胶、凝胶形成液体、含有脂质体或胶束的悬浮液、喷雾制剂或乳液。在某些情况下,局部眼部制剂还包括一种或多种医药上可接受的赋形剂,选自稳定剂、表面活性剂、聚合物基载体、凝胶剂、有机共溶剂、pH活性成分、渗透活性成分以及含或不含防腐剂。在某些情况下,将缓释半固体制剂、缓释固体制剂或眼部植入物注入需要治疗的眼部。在一些实施方案中,缓释半固体制剂、缓释固体制剂或眼部植入物还包括药学上可接受的赋形剂。在一些情况下,缓释半固体制剂、缓释固体制剂或眼部植入物包括CSF1或其受体抑制剂、CSF2多肽或其组合;以及已知生物可降解的聚合物,所述可生物降解的聚合物选自聚乳酸(PLA)、聚乙醇酸(PLGA)和聚乳酸和聚乙醇酸共聚物。

眼科制剂还包括至少一种眼科可接受的赋形剂,例如,但不限于:镇痛剂、张力调节剂、防腐剂、缓冲剂、pH调节剂、增溶剂、表面活性剂、螯合剂、渗透促进剂、乳化剂、悬浮剂、稳定剂,抗氧化剂、载体、增塑剂、释放改性或控制赋形剂、离子交换树脂等。合适的抗磨剂包括但不限于甘油、聚乙烯吡咯烷酮、聚乙烯氧化物、聚乙二醇(PEG),例如,但不限于PEG400、PEG300等或其组合;丙二醇、山梨醇和聚丙烯酸等或其组合。在本发明的组合物中可用的张力调节剂可包括但不限于盐,例如,但不限于氯化钠、氯化钾和氯化钙;非离子调节剂可包括但不限于丙二醇、甘油、甘露醇,右旋糖酐及其类似物或其组合。

合适的螯合剂可包括但不限于EDTA及其盐。可采用的增溶剂包括但不限于氧乙烯蓖麻油(CREMOPHOR

可采用的合适表面活性剂包括,但不限于,离子表面活性剂和非离子表面活性剂等或其组合。适宜的非离子表面活性剂包括,但不限于,泊洛沙姆、泰洛沙伯酯、聚山梨酸酯、聚氧乙烯蓖麻油衍生物、山梨醇酐酯、聚氧乙烯硬脂酸酯及其混合物。合适的药物载体包括无菌水;电解质,如氯化钠;葡萄糖;水或盐水中的葡萄糖;低烷醇、软膏碱,例如,但不限于,天然蜡,例如白蜂蜡、卡玛巴蜡、羊毛蜡(羊毛脂肪)、纯化羊毛脂、无水羊毛脂;石油蜡,例如固体石蜡,微晶蜡;碳氢化合物,例如液体石蜡、白色凡士林(例如白色

本发明所述组合物中可以包括修饰释放或控制释放赋形剂,例如但不限于聚合物修饰释放或控制释放赋形剂、非聚合物修饰释放或控制释放赋形剂或其组合。示例性释放改性或控制释放赋形剂包括鲸蜡酸甘油酯、壳聚糖、卡拉胶、纤维素衍生物(例如乙基纤维素、丙烯酸和甲基丙烯酸聚合物或共聚物等),或其衍生物或组合。本发明的眼科制剂可任选地包括额外黏性增进剂,例如,但不限于,纤维素及纤维素衍生物,例如,但不限于,甲基纤维素、羟丙基纤维素、羟乙基纤维素、乙基羟乙基纤维素、羟丙基甲基纤维素,羧甲基纤维素钠、醋酸纤维素及类似物或其组合;海藻酸、海藻酸钠、海藻酸丙二醇酯、聚乙烯吡咯烷酮、羧乙烯基聚合物或碳聚合物

本发明的眼科制剂可任选地包括额外胶凝剂,例如,但不限于,多糖胶,例如但不限于,结冷胶、罗望子胶、黄豆胶、刺槐豆胶、琼脂糖、卡拉胶、瓜尔胶、羟丙基瓜尔胶、透明质酸、壳聚糖、魔芋胶、金合欢、果胶、阿拉伯胶,凝乳聚糖、葡聚糖胶、硬化葡聚糖和硫酸葡聚糖硫酸盐及类似物或其组合;纤维素及其衍生物,例如但不限于,甲基纤维素、羧甲基纤维素、甲基纤维素、羟丙基纤维素、甲基羟丙基纤维素、羟丙基甲基纤维素、醋酸纤维素、乙基纤维素,甲基羟乙基纤维素、羟乙基纤维素、纤维素胶等或其组合;交联丙烯酸聚合物或卡波姆(CARBOPOL

上面的实施例列表是为了说明目的而给出的,并不打算详尽无遗。用于上述目的的其它药剂的实施例在眼科制剂中是众所周知的并且被包括在本发明的意图中。另外,本发明制剂中赋形剂的浓度可以是变化的。本发明的眼科制剂可为滴眼液、眼药水、悬浮液、分散液、凝胶、软膏、乳剂、胶体溶液、眼部插入物、眼部水凝胶、薄膜、微型片剂、纳米乳剂和微粒系统(例如但不限于脂质体、微粒、纳米粒子等)的形式。在一个实施方案中,本发明的眼科制剂以原位胶凝系统的形式存在。在另一实施方案中,本发明的原位型胶凝组合物可包含一种或多种交联剂,例如但不限于硼酸盐等等。在另一实施方案中,本发明之原位型胶凝组合物不包含一种或多种交联剂。

在进一步的实施方案中,本发明的眼部制剂以眼部插入物的形式存在,所述眼部插入物是可生物蚀解的眼部插入物。在另一个实施方案中,本发明的眼部制剂以眼部插入物的形式存在,所述眼部插入物是不可生物蚀解的眼部插入物。

本发明的眼科制剂可以是液体、固体或半固体剂型的形式。此外,在一个实施方案中,本发明的眼科制剂经调配以具有与眼睛相容的pH及渗透压。取决于本发明的最终剂量形式,本发明的眼科制剂可包括合适的眼科可接受赋形剂。在一个实施方案中,配制眼科制剂以维持生理上可耐受的pH范围。在一个实施方案中,眼科制剂的pH范围在5到9之间。在另一实施方案中,该眼科制剂的pH范围在6至8范围内。

在进一步的实施方案中,本发明的眼科制剂对眼部局部给药。在其他实施方案中,本发明的眼科制剂进行眼内给药或者眼周给药。在进一步的实施方案中,本发明的眼科制剂在眼睛腔内立即释放活性成分。

在另一个实施方案中,本发明的眼科制剂在眼睛腔内持续或者控制释放活性成分。在进一步的实施方案中,本发明的眼科制剂每日一次给药。在一个实施方案中,所述活性成分以大约24小时的持续时间从眼科制剂中持续释放传递或者控制释放传递。在另一个实施方案中,所述活性成分以大约12小时的持续时间从眼科制剂中持续释放传递或者控制释放传递。在进一步实施方案中,所述活性成分以大约10小时的持续时间从眼科制剂中持续释放传递或者控制释放传递。在依旧另一个实施方案中,所述活性成分以大约8小时的持续时间从眼科制剂中持续释放传递或者控制释放传递。在一个实施方案中,所述活性成分以大约6小时的持续时间从眼科制剂中持续释放传递或者控制释放传递。在进一步实施方案中,所述活性成分以大约4小时到大约24小时的持续时间从眼科制剂中持续释放传递或者控制释放传递。

根据本发明眼科制剂的剂型,采用适当的制备方法。可采用本领域已知的制备眼科制剂的各种方法。进一步取决于剂型,所述眼科制剂或其中使用的赋形剂和/或活性成分通过本领域技术人员已知的一种或多种方法进行适当灭菌。在一个实施方案中,通过本领域公知之成模或挤出程序制备以眼部插入物形式存在的本发明眼科制剂。在另一个实施方案中,通过将处方量的药物与眼科可接受赋形剂一起溶解或者悬浮在处方体积的载体溶剂中,来制备以眼科溶液形式存在的本发明眼科制剂。某些本发明眼科制剂的颗粒尺寸处于本发明所属技术领域普通技术人员已知的眼科可接受的范围内。

本发明的组合物可以有效用于治疗人或者动物。

组合物或制剂的给药可以是一天一次,一天两次,一天三次,一天四次或更频繁。在治疗的治疗维持阶段,频率可以降低,例如,每2天或每3天一次,而不是每天一次或每天两次。剂量和给药频率可根据治疗医生的判断进行调整,例如,考虑到用本方法治疗的疾病的临床症状、病理体征、临床和亚临床症状,以及患者的临床病史。

应当理解,本文所公开的用于治疗的试剂的量将随给药途径、所需治疗的条件的性质以及患者的年龄、体重和状况而变化,并且最终将由出席的医生自行决定。组合物通常包含有效量的CSF1或其受体抑制剂、CSF2多肽或其组合。初步剂量可根据动物试验确定,对人类给药的放大剂量实验可以以本领域可接受的操作惯例来进行。

治疗时间的长短,例如,治疗天数可以由治疗患者的医生很容易的确定;然而,治疗的天数可以在1天到大约365天的范围内。如本方法所述,在治疗过程中可监测治疗的疗效,以确定治疗是否成功,或是否需要额外(或进一步)治疗。

治疗化合物的剂量、毒性和疗效可通过细胞培养物或实验动物中的标准药物程序来确定,例如,用于测定LD50(对50%的群体致命的剂量)和ED50(对50%的群体有效的剂量)。CSF1和CSF1R抑制剂以及CSF2的剂型可以由本领域普通技术人员容易地确定,并且可以例如在文献中报告的动物模型和临床研究中获得,以根据本领域已知的标准方法来确定剂量、安全性和有效性。确切的配方、给药途径和剂量可由各位医生根据患者的情况选择。

在某些实施方案中,药物组合物包含抗CSF1抗体和CSF2重组肽。在某些实施方案中,药物组合物包含抗CSF1受体抗体和CSF2重组肽。在某些实施方案中,药物组合物包含抗CSF1抗体和抗CSF1受体抗体。在某些实施方案中,药物组合物包括抗CSF1抗体、抗CSF1受体抗体和CSF2多肽。在某些实施方案中,药物组合物包含CSF1抗体抑制剂和/或CSF1受体抑制剂和/或CSF2多肽。

在某些实施方案中,药物组合物包含治疗有效量的集落刺激因子-1(CSF1)或其受体抑制剂和集落刺激因子-2(CSF2)蛋白或者多肽。在某些实施方案中,CSF1或其受体的抑制剂,包括抗体、抗体片段、适体、小分子、反义寡核苷酸、siRNA试剂、Fab、Fab′,F(ab′)2片段、Fv片段、单链抗体、抗体模拟物、蛋白样体、细胞因子(cytokines)、细胞因子激动剂、细胞因子拮抗剂、细胞内因子(cellular factors),酶或其组合。

在某些实施方案中,本文所实施的药物组合物包括细胞因子、细胞因子激动剂、细胞因子拮抗剂或其组合。例如,药物组合物包括治疗有效量的集落刺激因子-1(CSF1)或其受体抑制剂和/或集落刺激因子-2(CSF2)蛋白质或多肽和/或细胞因子、细胞因子激动剂、细胞因子拮抗剂或其组合。

在某些实施方案中,CSF1或CSF1受体抑制剂被配制成眼部给药的形式。在某些实施方案中,CSF1抑制剂被配制成眼部给药的形式。在某些实施方案中,CSF2多肽或蛋白质被配制成眼部给药的形式。

在一些实施例中,所属抑制剂或者多肽经玻璃体内给药。示例性的CSF1或CSF受体抑制剂包括对CSF1或CSF1受体具有特异性的抗体。例如,被配制用于眼部给药的CSF1抑制剂。

作为选择或者与CSF1治疗相结合,所述治疗剂包括被配制成用于眼部给药方式的CSF2多肽或者蛋白。

本发明提供了CSF1、CSF1R的抑制剂、CSF2多肽或其组合物的制剂,被配制成溶液的形式,所述溶液的粘度与水相似。所述溶液包括药学上可接受的试剂/赋形剂,例如,不作为限制,环糊精。因此而制的的溶液是澄清的并且无色的溶液,适合于向眼睛局部施用。

本发明的溶液减少活性剂的前段暴露,从而使活性剂在溶液中的浓度增加,并增加传递频率,从而促进活性剂在眼睛后段保持高浓度。

本发明的溶液包含约0.005%至约95%w/v的作为活性试剂存在的CSF1抑制剂、CSF1R抑制剂、CSF2多肽或其组合,或其医药上可接受的盐。在一些实施方案中,CSF1抑制剂、CSF1R抑制剂、CSF2多肽或其组合在溶液中的浓度大约为0.005%-0.01%、大约0.01%-0.05%、大约0.05%-0.1%、大约0.1%-0.2%、大约0.2%-0.3%、大约0.3%-0.4%、大约0.4%-0.5%、大约0.5%-0.6%、大约0.6%-0.7%、大约0.7%-0.8%、大约0.8%-0.9%、大约0.9%-1.0%,大约1.0%-2.0%,大约2.0%-3.0%,大约3.0%-4.0%,大约4.0%-5.0%,0.005%-20%,大约0.005%-25%,大约0.005%-30%,大约0.005%-40%,大约0.005%-50%或更高w/v值,用于局部施用。在一些实施方案中,所述溶液包括大约0.005%、0.05%、0.1%、0.2%、0.3%、0.4%、0.5%、0.6%、0.7%、0.8%、0.9%、1.0%、2.0%、3.0%、4.0%、5.0%、10%、15%、20%、25%、30%、40%、50%或更高w/v的CSF1抑制剂、CSF1R抑制剂、CSF2多肽或其组合。

在一些实施方案中,所述制剂包括环糊精,以提高任意抑制剂的稳定性。化合物-I。环糊精是一种寡糖,由6到8个葡聚糖单位通过1个或者4个键相连,能够增加在水中或者水性溶液(例如,在磷酸缓冲液)中稳定性较差或者较低的活性成分的稳定性。环糊精于疏水性活性试剂形成疏水复合物。

在本发明的溶液中可使用一种或多种环糊精。用于本发明制剂中的环糊精的非限制性实例系是,例如:2-羟丙基-β-环糊精、甲基-β-环糊精、随机甲基化-β-环糊精、乙基化-β-环糊精、三乙酰基-β-环糊精、过氧乙酰化-β-环糊精、羧甲基-β-环糊精、羟乙基-β-环糊精,2-羟基-3-(三甲基氨)丙基-.β-环糊精、葡萄糖基-β-环糊精、麦芽糖基-β-环糊精、磺基丁基醚-、β-环糊精支链-β-环糊精、羟丙基-γ-环糊精、随机甲基化-γ-环糊精、三甲基-γ-环糊精或其组合。

除非另外定义,结合本发明使用的科学技术术语应该具有本发明所属技术领域普通技术人员普遍理解的含义(例如,在细胞培养领域、分子基因学领域和生物化学领域)。

如这里所使用的,单数形式“一个”、“一种”和“所述的”包括复数形式,除非上下文另有明确定义。因此,例如,当提到“一个疾病”、“一种疾病状态”或者“一种核酸”时,指的是其一种或者一种以上的实施方案,并且包括本领域普通技术人员所已知的各种等价物等等。

如本文所用,除非上下文要求更有限的范围,否则在数值或范围的上下文中术语“大约”意指所述或所主张的数值或范围的±10%。

如本文所用,术语“试剂”意指包括能够预防、改善或治疗疾病或其它医疗状况的任何分子、化学实体、组合物、药物、治疗剂、化学治疗剂或生物制剂。该术语包括小分子化合物、反义寡核苷酸、siRNA试剂、抗体、带有表位识别位点的抗体片段,例如Fab、Fab′、F(ab′)2片段、Fv片段、单链抗体、抗体模拟物(例如DARPins、亲和体分子、affilins、affitins、anticalins、avimers、fynomers、Kunitz域肽和单体)、肽样体、适体、酶、肽有机或无机分子、天然或合成化合物等。在临床试验期间、试验前试验期间或FDA批准后的任何阶段,可根据本发明的方法对试剂进行分析。

本文中的术语“抗体”在最广泛的意义上使用,包括多克隆和单克隆抗体,包括完整抗体和功能性(抗原结合)抗体片段,包括片段抗原结合(Fab)片段、F(ab′)2片段、Fab′片段、Fv片段、重组IgG(rlgG)片段、能够特异结合抗原的可变重链(VH)、单链抗体片段(包括单链可变片段(scFv)和单域抗体(例如sdAb、sdFv、纳米体)片段的区域。该术语包括免疫球蛋白的基因工程和/或其他修饰形式,例如体内抗体、蛋白体、嵌合抗体、全人类抗体、人源化抗体和异源结合抗体、多特异性抗体(例如双特异性抗体、抗体、双抗体、三抗体和四抗体、串联双单链抗体、串联三链抗体)。除非另有说明,术语“抗体”应理解为包括其功能性抗体片段。该术语还包括完整或全长抗体,包括任何类别或子类别的抗体,包括IgG及其子类别、IgM、IgE、IgA和IgD。术语“抗体”包括所有物种,包括人类抗体和人源化抗体以及抗原靶点,可以来自任何物种。因此,一种抗体,例如与抗原“X”结合的抗体可以是小鼠抗人X抗原、人抗人X抗原;人源化抗人X抗原、山羊抗人X抗原;山羊抗小鼠X抗原;大鼠抗人X抗原;小鼠抗鼠X抗原等等。在特定物种中产生的针对抗原靶点(例如来自另一物种的“X”)或在某些情况下相同物种(例如,在自身免疫或炎症反应中)产生的抗体的组合是无数的,并且所有这些都包含在本发明中。

“适体”是根据它们与其他分子结合的能力从随机池中挑选出来的DNA或RNA分子。适体特异性结合到靶分子上,其中核酸分子具有一种序列,该序列包含在其自然环境中被目标分子识别的序列。或者,适体可以是与靶分子结合的核酸分子,其中靶分子不自发地与核酸结合。目标分子可以是任何感兴趣的分子。例如,适体可用于与蛋白质的配体结合域结合,从而防止天然存在的配体与蛋白质的相互作用。这是一种非限制性实施例,本领域普通技术人员可以认识到,通过使用本领域已知的技术,其他实施方案可以容易的被生产出来(参见,例如,Gold et al.,Annu.Rev.Biochem.64:763,1995;Brody and Gold,J.Biotechnol.74:5,2000;Sun,Curr.Opin.Mol.Ther.2:100,2000;Kusser,J.Biotechnol.74:27,2000;Hermann and Patel,Science 287:820,2000;和Jayasena,Clinical Chem.45:1628,1999)。

在上述说明书和在权利要求中,诸如“至少一个”或“一个或多个”之类的短语可以出现在元素或特征的连词列表之后。术语“和/或”也可以出现在两个或多个元素或特征的列表中。除非与所使用的上下文另有隐含或明确的矛盾,否则该短语意指单独列出的任何元素或特征,或任何所述元素或特征与任何其他所述元素或特征的组合。例如,短语“A和B中的至少一个;A和B中的一个或多个;”以及“A和/或B”分别表示“A单独、B单独或A和B一起”。类似的解释也适用于包括三个或三个以上项目的列表。例如,短语“A、B和C中的至少一个”;“A、B和C中的一个或多个”;和“A、B和/或C”分别意指“A单独、B单独、C单独、A和B一起、A和C一起、B和C一起、或A和B和C一起使用。”此外,在上述和权利要求中使用术语“基于”意指,“至少部分基于”,这样一个未引用的特征或元素也是允许的。

应该理解的是,在提供参数范围的情况下,本发明还提供该范围内的所有整数及其十分之一。例如,“0.2-5mg”的公开是指0.2mg、0.3mg、0.4mg、0.5mg、0.6mg等至5.0mg(含5.0mg)。

“比较窗口”是指连续位置数目中任何一个的段(例如,至少约10至约100、约20至约75、约30至约50、100至500、100至200、150至200、175至200、175至225、175至250、200至225、200至250),其中可将序列与相同编号临近位置的参考序列最佳对齐之后进行比较。在各种实施方案中,比较窗口是两个对齐序列中的一个或两个的整个长度。在一些实施方案中,被比较的两个序列包括不同的长度,并且比较窗口是两个序列中较长或较短的整个长度。序列比对方法在本领域内是已知的。序列的视觉比对方法可以通过以下方式进行,例如,通过Smith&Waterman,Adv.Appl.Math.2:482(1981)公开的局部同源性阵列,通过Needleman&Wunsch,J.Mol.Biol.48:443(1970)公开的同源性对齐算法,通过Pearson&Lipman,Proc.Nat′l.Acad.Sci.USA 85:2444(1988)记载的检索相似性方法,通过计算机运行这些公式(Wisconsin基因软件包中的GAP,BESTFIT,FASTA,和TFASTA,GeneticsComputer Group公司,575Science Dr.,Madison,Wis.),或者通过人工对齐或者视觉观察检测(参见,例如《现代分子生物学手册》(Ausubel et al.,eds.1995副刊))。

在各种实施方案中,适于确定序列同一性和序列相似性百分比的算法是BLAST和BLAST 2.0算法,其在Altschul et al.,Nuc.Acids Res.25:3389-3402(1977)和Altschulet al.,J.Mol.Biol.215:403-410(1990)中分别进行了描述。BLAST和BLAST 2.0可用于确定核酸和蛋白质的序列同源性百分比。用于执行BLAST分析的软件通过本领域已知的国家生物技术信息中心公开可用。该算法首先通过识别查询序列中长度为W的短单词来识别高分序列对(HSPs),当与数据库序列中相同长度的单词对齐时,这些单词要么匹配要么满足某个正值阈值T。T被称为邻域词得分阈值(Altschul等人,上文)。这些最初的邻域词点击作为启动搜索的种子,以找到包含它们的较长hsp。单词命中沿着每个序列向两个方向扩展,直到累积对齐分数可以增加为止。对于核苷酸序列,使用参数M(一对匹配残基的奖励分数;始终>0)和N(不匹配残基的惩罚分数;始终<0)来计算累积分数。对于氨基酸序列,使用评分矩阵计算累积得分。在以下情况下,单词在每个方向上的扩展将停止:累计对齐分数从其最大实现值减去X;由于一个或多个负分数剩余对齐的累积,累积分数变为零或以下;或达到任一序列的结尾。BLAST算法参数W、T和X决定了对齐的灵敏度和速度。BLASTN程序(用于核苷酸序列)默认使用wordlength(W)为11,expectation(E)为10,M=5,N=-4,并对两条链进行比较。对于氨基酸序列,BLASTP程序默认使用wordlength为3,expectation(E)为10,BLOSUM62评分矩阵(见Henikoff&Henikoff,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89:10915(1989)),alignments(B)为50,expectation(E)为10,M=5,N=-4,并对两条线进行比较。

过渡术语“包含”与“包括”、“包含”或“其特征在于”同义,是包含性或开放性的,不排除附加的、未引用的元素或方法步骤。相比之下,过渡短语“由...组成”不包括权利要求中未规定的任何元素、步骤或成分。过渡短语“基本上包括”将权利要求的范围限定为特定的材料或步骤”以及那些不会实质性地影响要求保护的发明的基本和新颖特征的材料或步骤。

如本文所用,术语“细胞因子”泛指由一个细胞群体释放的蛋白质,该蛋白质作为细胞间介质作用于另一个细胞或对产生该蛋白质的细胞具有自分泌作用。此类细胞因子的实例包括淋巴因子、单因子;白细胞介素(“ILs”),例如IL-1、IL-1α、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-8、IL-9、IL-10、IL-11、IL-12、IL-13、IL-15、IL-17A-F、IL-18至IL-29(例如IL-23)、IL-31,包括PROLEUKINTM rIL-2;肿瘤坏死因子,例如TNF-α或TNF-β、TGF-β1-3;和其他多肽因子包括白血病抑制因子(“LIF”)、睫状神经营养因子(“CNTF”)、CNTF样细胞因子(“CLC”)、心脏营养素(“CT”)和kit配体(“KL”)。

如本文所用,当提及治疗化合物的量时,“有效”是指当以以下方式使用时,足以产生期望的治疗反应而没有不适当的不良副作用(例如毒性、刺激性或过敏性反应)的化合物的量,该量与这里所公开的使用方式的合理的效益/风险比率相称。

“赋形剂”在本文中用于包括可包含在一个或多个所公开的抑制剂或CSF2多肽中或与之组合的任何其他化合物,这些其他化合物不起到治疗作用或不属于生物活性化合物。因此,赋形剂应为药学或生物学上可接受或相关的(例如,赋形剂一般应对受试者无毒)。“赋形剂”包括一种单一的此类化合物,并且还预计包括多个赋形剂。就本申请的目的而言,术语“赋形剂”和“载体”在本申请的整个描述中可互换地使用,并且所述术语在本文中被定义为“用于配制安全有效的药物组合物的实践中使用的成分”。

术语抗体的“高亲和力”是指抗体对其所靶向的抗原的K

术语“同源的”或百分比“同一性”在两个或两个以上的核酸或多肽序列的上下文中是指两个或多个序列或子序列具有相同的氨基酸残基或相同的核苷酸,或具有特定百分比的相同的氨基酸残基或相同的核苷酸(例如,在特定的区域内同源性为50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%,95%、96%、97%、98%、99%或更多,例如,整个多肽序列或其单个域),当在比较窗口或者指定区域内进行比较或者进行最大对齐时,通过手动对齐和目视检查,使用序列比对算法测量。这种至少约80%相同的序列被称为“基本相同”。在一些实施方案中,两个序列是100%相同的。在某些实施方案中,两个序列在其中一个序列(例如,具有不同长度的两个序列中较短的序列)的整个长度上是100%相同的。在各种实施方案中,同源性可能是指检测序列的补体。在一些实施方案中,该同源性存在于一定长度上,所述长度至少大约10至大约100、大约20至大约75、大约30至大约50个氨基酸或核苷酸。在某些实施方案中,该同源性存在于长度至少约50个氨基酸的区域上,或更优选地存在于长度为100到500、100到200、150到200、175到200、175到225、175到250、200到225、200到250或更多个氨基酸的区域上。

如本文所用,“分离的”或“纯化的”核酸分子、多核苷酸、多肽或蛋白质在通过重组技术生产时基本上不含其他细胞材料或培养基,或在化学合成时不含化学前体或其他化学品。纯化的化合物是指至少60%的重量(干重)为感兴趣化合物。优选地,所述制剂按重量计为至少75%、更优选至少90%、且最优选至少99%的重量是感兴趣的化合物。例如,纯化化合物系指按重量计至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、98%、99%或100%(w/w)的重量是理想化合物。纯度可通过任何适当的标准方法进行测量,例如,柱色谱法、薄层色谱法或高效液相色谱法(HPLC)分析法。一个纯化或分离的多核苷酸(核糖核酸(RNA)或脱氧核糖核酸(DNA))在其自然存在状态下不含基因或序列。一种纯化或分离的蛋白质或肽在其自然存在的状态下不含氨基酸或氨基酸序列。纯化还定义了一种无菌程度,也就是说,可以安全的对人类患者给药,例如,不含感染性试剂或者毒性试剂。类似地,所谓“基本上纯的”是指从自然伴随的成分中分离出来的核苷酸或多肽。通常,当核苷酸和多肽的重量至少为60%、70%、80%、90%、95%或甚至99%时,不含其自然伴随的蛋白质和天然存在的有机分子时,核苷酸和多肽基本上是纯的。

如本说明书和所附权利要求书中使用的,术语“或者”基本上被用于表示包括“和/或”的意思,除非上下文中另有明确说明。

“序列同一性百分比”通过在比较窗口上比较两个最佳排列的序列来确定,其中两个序列的最佳对齐时与参考序列(不包括添加或删除)相比,比较窗口中的多核苷酸或多肽序列部分可以包括添加或删除(即,间隙)。百分比是计算获得的,通过确定两个序列中相同的核酸碱基或氨基酸残基出现的位置数量从而得出匹配位置的数量,将匹配的位置数除以比较窗口中的位置总数,然后将结果乘以100,得到序列一致性的百分比。对于序列比较,通常一个序列充当参考序列,测试序列与之进行比较。在各种实施方案中,当使用序列比较算法时,将测试序列和参考序列输入到计算机中,如有必要,指定子序列坐标,并指定序列算法程序参数。优选地,可以使用默认程序参数,或者可以指定替代参数。然后计算序列比较算法,根据程序参数计算测试序列相对于参考序列的序列百分比。

如本文所用,“医药上可接受的”载体或赋形剂是指适合与人类和/或动物一起使用的载体或赋形剂,其没有与合理的效益/风险比率相称的不当的不良副作用(例如毒性、刺激性和过敏反应)。例如,它可以是医药上可接受的溶剂、悬浮剂或载体,用于将本发明化合物递送给受试者。

“参照”指的是标准条件或者对照条件。

“小分子”是一种质量小于2000道尔顿的化合物。小分子的分子质量优选小于1000道尔顿,更优选小于600道尔顿,例如,化合物小于500道尔顿、400道尔顿、300道尔顿、200道尔顿或100道尔顿。

如这里使用的,能够“特异性结合”靶点的抗体指的是一种靶点配位体,例如,所述抗体与靶点的结合K

本文中使用的术语“受试者”、“患者”、“个体”等等并不起到任何限制作用,并且通常可以互换使用。也就是说,一个被描述为“病人”的人不一定患有某种特定的疾病,而可能只是在寻求医疗建议。本文所用术语“受试者”包括被诊断患有视神经病变的个体。例如,患者被诊断为眼压升高。或者,患者的特征是在没有眼压升高的情况下包括视神经病变。在某些情况下,早期青光眼的特点是在眼压没有升高的情况下CSF1和/或CSF2水平异常。这些患者受益于使用本文所述的组合物和方法的早期治疗。

如这里所使用的,以疾病相关的“症状”包括与该病症相关的任何临床或实验室表现,并且不局限于受试者能够感觉到或观察到的内容。

如本文所用,“治疗”包括,例如,对疾病进展进行抑制、消退或停滞。治疗还包括预防或改善疾病的一个或者多个症状。如本文所用,“抑制”患者的疾病进展或疾病并发症是指防止或减少患者的疾病进展和/或疾病并发症。

当用于指抗体时,例如抗体片段时,术语“可变区”或“可变域”是指参与将抗体与抗原结合的抗体重链或轻链的结构域。天然抗体的重链可变区和轻链可变区(分别VH和VL)通常具有相似的结构域,每个结构域包括四个保守框架区(FR)和三个CDR。(参见,例如,Kindt et al.Kuby Immunology,6th ed.,W.H.Freeman and Co.,page 91(2007).单链V

这里公开的所有的基因、基因名称和基因产物意指包括其任意种类的相应物或者同源物,可用于这里公开的组合物和方法中。因此,这些术语包括,但是不局限于来自人类或者老鼠的基因或者基因产物。可以理解的是,当这里公开的是来源于特定物种的基因或者基因产物时,这里的公开只起到示例性作用,并不应该被理解为是对本发明的限制,除非上下文种另有明确定义。因此,例如,对于这里公开的基因或者基因产物,在某些实施方案中指的是哺乳动物核酸和氨基酸序列,但意在包括来源于其他动物(包括但是不局限于,其他哺乳动物、鱼、两栖动物、爬行动物和鸟类)的基因或者基因产物的同源物和/或类似物。在优选的实施方案种,所述基因、核酸序列、氨基酸序列、肽、多肽和蛋白质是来源于人类的。

这里通过附录号引用的Genbank和NCBI附录通过引证在此全部并入本文。这里引用的所有其他公开的参考文献、文件、手稿和科技文献通过引证在此全部并入本文。如果出现矛盾的话,以本说明书(包括定义)为准。另外,所有的材料、方法和实施例只起到说明作用并不作为本发明的限制。

其他实施方案

尽管本发明已经结合具体实施方式进行了详细的描述,上述说明书只起到解释的作用,并不以任何方式作为对本发明范围的限制,本发明的范围由所附权利要求书的范围定义。其他方面、优势和修饰也包括在所附权利要求书的范围内。

这里引用的专利和科技文献建立了本领域普通技术人员可获得的知识内容。所有的美国专利以及公开的或者未被公开的美国专利通过引证在此全部并入本文。所有公开的外国专利和专利申请通过引证在此全部并入本文。这里通过附录号引用的Genbank和NCBI附录通过引证在此全部并入本文。这里引用的所有其他公开的参考文献、文件、手稿和科技文献通过引证在此全部并入本文。

尽管本发明已经参考其优选的实施方案进行了具体显示和描述,本领域普通技术人员应该理解在不脱离本发明所附权利要求书包括的范围的基础上,本发明的形式和细节可以进行多种变化。

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