毛细管电泳和质谱联用的直接RNA测序技术

摘要

本发明涉及一种直接对RNA的序列及其化学修饰同时进行测定的技术。和DNA相比，对RNA上化学修饰的研究相对滞后，其主要原因在于没有一种方便精准的方法检测这些化学修饰。本发明针对现行间接RNA测序技术的种种问题，直接对RNA进行序列测定。先将RNA降解成长短不一的梯坎RNA片段，再用毛细管电泳和质谱联用分析检测这些降解的RNAs。每一个降解的梯坎RNA片段都对应着不同的迁移时间和不同的质谱值。把这些长短不一的梯坎RNA片段从小到大排序，再用这些梯坎RNA片段之间质谱差值来计算原RNA从5`和3`的碱基序列。本技术不仅可以直接对常规的RNA测序，而且可以同时测定这些RNA上的化学修饰。