一种新的融合遗传信息的蛋白质序列表示方法

摘要

本发明提供一种新的融合遗传信息的蛋白质序列表示方法，将蛋白质P序列中的保守区氨基酸不变，非保守区域氨基酸按照其PSSM矩阵突变为其它氨基酸概率的大小依次转换成其它氨基酸，这样就可以得到20条含有蛋白质P遗传信息的虚拟蛋白质，将蛋白质P与虚拟蛋白质组，合成新的蛋白质P的向量描述，以解决蛋白质二级结构类型预测及亚细胞定位预测率较低的问题。本发明提出的方法与现有融合进化信息方法相比，具有更明显的生物学意义，采用最具可能进化的蛋白质组来表示某一个蛋白质，能明显提高相关预测器的预测成功率，具有广阔的运用空间。