用于核酸作图和鉴定核酸中的精细结构变化的方法

摘要

本发明提供并列序列标签(GVT)的方法，所述并列序列标签为沿着靶核酸分子群的长度的独特位置标记，所述方法包括：将靶核酸分子片段化以形成靶DNA插入物；将靶DNA插入物与DNA载体或骨架连接，以产生环状分子；用内切核酸酶消化靶DNA插入物，以在离靶DNA插入物各个末端一定的距离切割靶DNA插入物，得到包含与未消化线状骨架连接的靶DNA插入物末端序列的两个GVT；重新环化具有连接的GVT的线状骨架，得到包含具有两个并列的GVT对的环状DNA；和通过核酸扩增或用具有GVT对侧翼位点的内切核酸酶消化，回收GVT对DNA。将粘粒载体提供用于产生可被下一代DNA序列分析仪测序的约45-50kb间隔的GVT对。