一种采用链状多种群的遗传算法从体液代谢轮廓中筛选肝病标志物的方法

摘要

一种采用链状多种群的遗传算法从体液代谢轮廓中筛选肝病标志物的方法，属于数据挖掘、代谢组学技术领域。其特征是首先采用液相色谱质谱联用仪对体液代谢物进行分析得到代谢轮廓，通过多种群并行进化得到多个区分能力强的特征子集，根据特征在这些子集中出现频数度量特征的重要性。其次依据特征的重要性采用顺序从前向后搜索，筛选出肝病三阶段特异性的标志物。在进化中相邻种群通过信息交互，避免了遗传算法的早熟缺点。同时提出了一种新的交叉操作，保证了任意一个染色体中不包含相同特征。本发明的效果和益处是可以高效，准确的筛选出肝病三阶段中相关的标志物，准确率高，稳定性好，利用筛选出来的特征构造的SVM模型的10倍交叉验证准确率达97.9％。