一种基于深度测序的适用于HIV-1蛋白酶劣势耐药毒株检测方法

摘要

本发明公开了一种基于深度测序的适用于HIV‑1蛋白酶劣势耐药毒株检测方法。本发明提供了用于HIV PR耐药检测的引物组，由SEQ ID No.1‑6所示六条引物，以及分别在SEQ ID No.7和SEQ ID No.8的5’末端连接Barcode序列后所示两条引物组成。本发明中PR的cDNA合成和巢式PCR第一轮扩增在同一反应体系中完成；巢式PCR第二轮扩增中在引物的首尾加上Barcode序列；第二轮扩增产物纯化后进行高通量测序，从而获得HIV‑1PR劣势耐药毒株信息。本发明建立的新型HIV‑1蛋白酶劣势耐药毒株耐药检测方法，低成本、产出高。本发明对于艾滋病防治和公共卫生具有重大影响。