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一代基因测序中自动识别杂合突变的方法

摘要

本发明涉及一种一代基因测序中自动识别杂合突变的方法,包括以下步骤:S1将一代基因测序结果中各个碱基的检出信号数据转换为横坐标为正实数点位;S2计算各整数点位上各个碱基检出信号强度包络面积;S3将各整数点位分组,使得每个分组内各碱基检出信号的最大包络面积数值相接近;S4在所述的每个整数点位分组内各自确定用于识别杂合突变的面积差阈值和面积比阈值;S5使用噪声识别算法标识出被测序列中的噪声整数点位集合;S6根据其所在的整数点位分组确定面积差阈值和面积比阈值;计算该整数点位的面积最大的两种碱基的面积差和面积比,判定突变。本发明可提升杂合突变的识别效率及准确率,降低人工成本。

著录项

  • 公开/公告号CN111161801A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-05-15

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 杨琦;

    申请/专利号CN201911403408.2

  • 申请日2019-12-31

  • 分类号

  • 代理机构南京天华专利代理有限责任公司;

  • 代理人陆海天

  • 地址 210000 江苏省南京市建邺区汉中门大街99号金基公寓3栋2单元604室

  • 入库时间 2023-12-17 09:04:09

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-06-09

    实质审查的生效 IPC(主分类):G16B30/00 申请日:20191231

    实质审查的生效

  • 2020-05-15

    公开

    公开

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