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Image reconstruction for sub-sampled atomic force microscopy images using deep neural networks

机译:使用深神经网络的子采样原子力显微镜图像重建

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摘要

Undersampling is a simple but efficient way to increase the imaging rate of atomic force microscopy (AFM). One major challenge in this approach is that of accurate image reconstruction from a limited number of measurements. In this work, we present a deep neural network (DNN) approach to reconstruct mu-path sub-sampled AFM images. Our network consists of two sub-networks, namely a RED-net and a U-net, in series, and is trained end-to-end from random images masked according to mu-path sub-sampling patterns. Using both simulation and experiments, the DNN is shown to yield better image quality than three existing optimization-based methods for reconstruction: basis pursuit, a variant of total variation minimization, and inpainting.
机译:UnderAppling是一种简单但有效的方法来提高原子力显微镜显微镜(AFM)的成像速率。 这种方法中的一个主要挑战是从有限数量的测量中重建准确的图像重建。 在这项工作中,我们介绍了一种深度神经网络(DNN)方法来重建MU-PATH子采样AFM图像。 我们的网络由两个子网,即Red-Net和U-Net串联组成,并且从根据MU路子采样模式屏蔽的随机图像训练的终端到底。 使用模拟和实验,DNN被证明,比三种现有的基于优化的重建方法产生更好的图像质量:基础追踪,总变化最小化的变体和染色。

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