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In vitro assessment of hepatotoxicity by metabolomics: a review

机译:代谢组科对肝毒性的体外评估:综述

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摘要

Omics technologies, and in particular metabolomics, have received an increasing attention during the assessment of hepatotoxicity in vitro. However, at present, a consensus on good metabolomics practices has yet to be reached. Therefore, in this review, a range of experimental approaches, applied methodologies, and data processing workflows are compared and critically evaluated. Experimental designs among the studies are similar, reporting the use of primary hepatocytes or hepatic cell lines as the most frequently used cell sources. Experiments are usually conducted in short time-frames (
机译:在体外评估肝毒性期间,OMICS技术和特定代谢组织在肝毒性评估期间受到了越来越长的关注。但是,目前,尚未达成对良好代谢物种做法的共识。因此,在本次综述中,比较了一系列实验方法,应用方法和数据处理工作流程和批判性评估。研究中的实验设计是相似的,报告使用原发性肝细胞或肝细胞系作为最常用的细胞来源。实验通常在副毒性剂量的短时间框架(<β48≤H)中进行。应用的样品制剂是蛋白质沉淀或Bligh-和染色萃取。大多数分析平台依赖于使用高分辨率仪器的质谱检测色谱分离。通常用于允许同时检测几种代谢物的代谢组,包括最初与毒性有关的内源代谢物。该非偏置检测平台是一种有助于产生基于假设的机械研究的有价值的工具。在毒理脉冲下改变的最常报告的代谢产物是丙氨酸,乳酸和脯氨酸,其通常是相关的。体外肝毒性的其他未特异性生物标志物是胆碱,谷胱甘肽和3-磷甘油糖的下调。克雷布斯循环的破坏与增加的谷氨酸,色氨酸和缬氨酸有关。磷脂改变在脂肪变性,脂肪凋亡和氧化应激中描述。虽然质量控制的趋势日益增长,但数据分析程序往往不遵循良好的当代代谢组种实践,包括特征过滤,假发现率校正,并报告代谢物注释的置信。目前注释的生物标志物可用于一般鉴定肝毒性并在一定程度上提供机械区的工具。

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