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ProtMiscuity: a database of promiscuous proteins

机译:混杂:混杂蛋白质的数据库

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摘要

Promiscuous behaviour in proteins and enzymes remains a challenging feature to understand the structure–function relationship. Here we present ProtMiscuity, a manually curated online database of proteins showing catalytic promiscuity. ProtMiscuity contains information about canonical and promiscuous activities comprising 88 different reactions in 57 proteins from 40 different organisms. It can be searched or browsed by protein names, organisms and descriptions of canonical and promiscuous reactions. Entries provide information on reaction substrates, products and kinetic parameters, mapping of active sites to sequence and structure and links to external resources with biological and functional annotations. ProtMiscuity could assist in studying the underlying mechanisms of promiscuous reactions by offering a unique and curated collection of experimentally derived data that is otherwise hard to find, retrieve and validate from literature.
机译:蛋白质和酶的混杂行为仍然是理解结构与功能关系的一项具有挑战性的特征。在这里,我们介绍ProtMiscuity,这是一种人工管理的在线蛋白质在线数据库,显示了催化混杂。 ProtMiscuity包含有关规范和混杂活动的信息,包括来自40种不同生物的57种蛋白质中的88种不同反应。可以通过蛋白质名称,生物体以及规范和混杂反应的描述进行搜索或浏览。条目提供有关反应底物,产物和动力学参数,活性位点与序列和结构的映射以及与具有生物学和功能注释的外部资源的链接的信息。 ProtMiscuity可以通过提供独特且精选的实验得出的数据来协助研究混杂反应的潜在机制,否则这些数据很难从文献中找到,检索和验证。

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