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L.U.St: a tool for approximated maximum likelihood supertree reconstruction

机译:L.U.St:近似最大似然超树重建的工具

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摘要

BackgroundSupertrees combine disparate, partially overlapping trees to generate a synthesis that provides a high level perspective that cannot be attained from the inspection of individual phylogenies. Supertrees can be seen as meta-analytical tools that can be used to make inferences based on results of previous scientific studies. Their meta-analytical application has increased in popularity since it was realised that the power of statistical tests for the study of evolutionary trends critically depends on the use of taxon-dense phylogenies. Further to that, supertrees have found applications in phylogenomics where they are used to combine gene trees and recover species phylogenies based on genome-scale data sets.
机译:背景超级树结合了完全不同的,部分重叠的树,从而生成了一个综合视图,提供了从单个系统发育检查中无法获得的高级视角。超级树可以看作是元分析工具,可用于根据先前科学研究的结果进行推断。自从人们意识到统计测试对进化趋势的研究的能力严重依赖于分类密集的系统发育的使用以来,它们的元分析应用日益普及。除此之外,超树已经在系统发育组学中找到了应用,其中超树用于组合基因树并根据基因组规模的数据集恢复物种的系统发育。

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