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Laboratory Information Management Software for genotyping workflows: applications in high throughput crop genotyping

机译:用于基因分型工作流程的实验室信息管理软件:在高通量作物基因分型中的应用

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摘要

BackgroundWith the advances in DNA sequencer-based technologies, it has become possible to automate several steps of the genotyping process leading to increased throughput. To efficiently handle the large amounts of genotypic data generated and help with quality control, there is a strong need for a software system that can help with the tracking of samples and capture and management of data at different steps of the process. Such systems, while serving to manage the workflow precisely, also encourage good laboratory practice by standardizing protocols, recording and annotating data from every step of the workflow.
机译:背景技术随着基于DNA测序仪的技术的进步,使基因分型过程的多个步骤实现自动化已成为可能,从而提高了通量。为了有效处理产生的大量基因型数据并帮助进行质量控制,迫切需要一种软件系统,该软件系统可以在过程的不同步骤中帮助跟踪样本以及捕获和管理数据。这样的系统在精确管理工作流程的同时,还通过标准化协议,记录和注释工作流程各个步骤中的数据来鼓励良好的实验室实践。

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